| |
|
|
| |
Izvorni znanstveni i pregledni radovi u CC časopisima
|
| |
1. Baharoglu, Zeynep; Petranović, Mirjana; Flores, Maria-Jose; Michel, Bénédicte.
RuvAB is essential for replication fork reversal in certain replication mutants. // EMBO Journal. 25 (2006) , 3; 596-604 (članak, znanstveni).
|
2. Đermić, Damir; Đermić, Edyta; Zahradka, Davor; Petranović, Mirjana; Lerš, Nella.
Gamma-irradiated RecD overproducers become permanent recB-/C- phenocopies for extrachromosomal DNA processing due to prolonged titration of RecBCD enzyme on damaged Escherichia coli chromosome. // Biochimie. 88 (2006) , 3-4; 379-386 (članak, znanstveni). 
|
3. Đermić, Damir; Zahradka, Davor; Petranović, Mirjana.
Exonuclease requirements for recombination of lambda phage in recD mutants of Escherichia coli. // Genetics. 173 (2006) , 4; 2399-2402 (članak, znanstveni).
|
4. Zahradka, Ksenija; Šimić, Sanela; Buljubašić, Maja; Petranović, Mirjana; Đermić, Damir; Zahradka, Davor.
sbcB15 and delsbcB mutations activate two types of
RecF recombination pathway in Escherichia coli. // Journal of bacteriology. 188 (2006) , 21; 7562-7571 (članak, znanstveni).  
|
5. Zahradka, Ksenija; Slade, Dea; Bailone, Adriana; Sommer, Suzanne; Averbeck, Dietrich; Petranović, Mirjana; Lindner, Ariel B.; Radman, Miroslav.
Reassembly of shattered chromosomes in Deinococcus radiodurans. // Nature. 443 (2006) ; 569-573 (članak, znanstveni).
|
6. Đermić, Damir; Halupecki, Edyta; Zahradka, Davor; Petranović, Mirjana.
RecBCD enzyme overproduction impairs DNA repair and homologous recombination in Escherichia coli. // Research in microbiology. 156 (2005) , 3; 304-311 (članak, znanstveni).
|
7. Boel, G.; Pichereau, V.; Mijakovic, I.; Maze, A.; Poncet, S.; Gillet, S.; Giard, J.C.; Hartke, A.; Auffray, Y.; Deutscher, J.
Is 2-phosphoglycerate-dependent automodification of bacterial enolases implicated in their export?. // Journal of Molecular Biology. 337 (2004) , 2; 485-496 (članak, znanstveni).
|
8. Maze, A.; Boel, G.; Poncet, S.; Mijakovic, I.; Le Breton Y.; Benachour, A.; Monedero, V.; Deutscher, J.; Hartke, A.
The Lactobacillus casei ptsHI47T mutation causes overexpression of a LevR-regulated but RpoN-independent operon encoding a mannose class phosphotransferase system. // Journal of bacteriology. 186 (2004) , 14; 4543-4555 (članak, znanstveni).
|
9. Petranović, Dina; Mijaković, Ivan.
Photometric assay for measuring the intracellular concentration of branched-chain amino acids in bacteria. // Journal of Microbiological Methods. 56 (2004) , 1; 133-136 (članak, znanstveni).
|
10. Poncet, S.; Mijakovic, I.; Nessler, S.; Gueguen-Chaignon, V.; Chaptal, V.; Galinier, A.; Boel, G.; Maze, A.; Deutscher, J.
HPr kinase/phosphorylase, a Walker motif A-containing bifunctional sensor enzyme controlling catabolite repression in Gram-positive bacteria. // Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics. 1697 (2004) , 1-2; 123-135 (članak, znanstveni).
|
11. Džidić, Senka; Bačun-Družina, Višnja; Petranović, Mirjana.
The role of mismatch repair in bacterial evolution. // Food Technology and Biotechnology. 41 (2003) , 2; 177-182 (pregledni rad, znanstveni).
|
12. Džidić, Senka; Bedeković, Vlado.
Horizontal gene transfer-emerging multidrug resistance in hospital bacteria.. // Acta pharmacologica sinica. 24 (2003) , 6; 519-526 (članak, znanstveni).
|
13. Džidić, Senka; Petranović, Mirjana.
Mismatch repair in the antimutator Escherichia coli mud. // Mutation research. Fundamental and molecular mechanisms of mutagenesis. 522 (2003) , 1-2; 27-32 (članak, znanstveni).
|
14. Grangeasse, C.; Obadia, B.; Mijaković, I.; Deutscher, J.; Cozzone, A.J.; Doublet, P.
Autophosphorylation of the Escherichia coli protein kinase Wzc regulates tyrosine phosphorylation of Ugd, a UDP-glucose dehydrogenase. // The Journal of biological chemistry. 278 (2003) , 41; 39323-39329 (članak, znanstveni).
|
15. Mijaković, I.; Poncet, S.; Boel, G.; Maze, A.; Gillet, S.; Jamet, E.; Decottignies, P.; Grangeasse, C.; Doublet, P.; Le Marechal, P.; Deutscher, J.
Transmembrane modulator-dependent bacterial tyrosine kinase activates UDP-glucose dehydrogenases. // EMBO journal. 22 (2003) , 18; 4709-4718 (članak, znanstveni).
|
16. Viguera, Enrique; Petranović, Mirjana; Zahradka, Davor; Germain, Karine; Erlich, Dusko S.; Michel, Benedicte.
Lethality of bypass DNA polymerases in Escherichia coli cells with a defective clamp loader complex of DNA polymerase III. // Molecular microbiology. 50 (2003) , 1; 193-204 (članak, znanstveni).
|
17. Fieulaine, S.; Morera, S.; Poncet, S.; Mijaković, I.; Galinier, A.; Janin, J.; Deutscher, J.; Nessler, S.
X-ray structure of a bifunctional protein kinase in complex with its protein substrate HPr. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (2002) , 21; 13437-13441 (članak, znanstveni).
|
18. Ivančić-Baće, Ivana; Škrobot, Nikolina; Zahradka, Davor; Salaj-Šmic, Erika; Brčić-Kostić, Krunoslav.
Genetic requirements for conjugational recombination in the presence of lambda Gam protein in Escherichia coli. // Food Technology and Biotechnology. 40 (2002) , 4; 261-265 (članak, znanstveni).
|
19. Mijaković, I.; Poncet, S.; Galinier, A.; Monedero, V.; Fieulaine, S.; Janin, J.; Nessler, S.; Marquez, J.A.; Scheffzek, K.; Hasenbein, S.; Hengstenberg, W.; Deutscher, J.
Pyrophosphate-producing protein dephosphorylation by HPr kinase/phosphorylase: a relic of early life?. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (2002) , 21; 13442-13447 (članak, znanstveni).
|
20. Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana; Đermić, Damir; Brčić-Kostić, Krunoslav.
The RuvABC resolvase is indispensable for
recombinational repair in sbcB15 mutants of
Escherichia coli. // Journal of bacteriology. 184 (2002) , 15; 4141-4147 (članak, znanstveni).
|
|
|
|
|
| |
Znanstveni radovi u drugim časopisima
|
| |
1. Mijaković, Ivan; Petranović, Dina; Deutscher, Joseph.
How tyrosine phosphorylation affects the UDP-glucose dehydrogenase activity of Bacillus subtilis YwqF. // Journal of molecular microbiology and biotechnology. 8 (2004) , 1; 19-25 (članak, znanstveni).
|
2. Bačun-Družina, Višnja; Džidić, Senka; Perić, Nataša; Ivančić, Mirela; Franekić Čolić, Jasna.
The induction of Escherichia coli aidB gene in Salmonella typhimurium. // Periodicum biologorum. 105 (2003) , 3; 257-262 (članak, znanstveni).
|
3. Boel, G.; Mijaković, I.; Maze, A.; Poncet, S.; Taha M. K.; Larribe, M.; Darbon, E.; Khemiri, A.; Galinier, A.; Deutscher, J.
Transcription regulators potentially controlled by HPr kinase/phosphorylase in Gram-negative bacteria. // Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 5 (2003) , 4; 206-215 (pregledni rad, znanstveni).
|
4. Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Džidić, Senka; Đermić, Damir; Petranović, Mirjana.
The rus-1 mutation suppresses cytological defects in recBC sbcBC ruv mutants of Escherichia coli. // Periodicum Biologorum. 104 (2002) , 4; 389-397 (članak, znanstveni).
|
5. Zahradka, Ksenija; Zahradka, Davor; Đermić, Damir; Džidić, Senka; Petranović, Mirjana.
The inactivation of free phages in UV-irradiated
Escherichia coli. // Periodicum Biologorum. 104 (2002) , 4; 399-403 (članak, znanstveni).
|
|
|
|
|
|
|
| |
Kongresno priopćenje (sažeci) u ostalim časopisima
|
| |
1. Zahradka, Davor; Buljubašić, Maja; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana.
Homologous Recombination and DNA Repair in recBC sbcBC Mutants of Escherichia coli: Effects of a recG Mutation // abstracts of the 1st Central European Forum for Microbiology (CEFORM) ; u: Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica. Supplement 52 (2005) (S) / Marialigeti, K. ; Sipos, R. (ur.).
Budimpešta : Akadémiai Kiadó, 2005. 174-175 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
2. Zahradka, Ksenija; Bailone, Adriana; Averbeck, Dietrich; Petranović, Mirjana; Radman, Miroslav.
Deinococcus radiodurans: The Most Efficient DNA Repair Involves Coupled Replication and Recombination Processes // Abstracts of The 1st Central European Forum for Microbiology (CEFORM) ; u Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica. Supplement 52 (2005) (S) / Marialigeti, K. ; Sipos, R. (ur.).
Budimpešta : Akadémiai Kiadó, 2005. 175-175 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
|
|
|
|
|
|
| |
Sažeci u zbornicima skupova
|
| |
1. Buljubašić, Maja; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana; Zahradka, Davor.
Effects of a recG mutation on homologous recombination and DNA repair in recBC sbcBC mutants of Escherichia coli // Zbornik sažetaka 9. hrvatskog biološkog kongresa s međunarodnim sudjelovanjem / Besendorfer, Višnja ; Klobučar, Goran (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2006. 71-73 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
2. Buljubašić, Maja; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana; Zahradka, Davor.
Effects of a recG mutation on homologous recombination and DNA repair in recBC sbcBC mutants of Escherichia coli // 1st MedILS Summer School, Structure and Evolution: from Bench to Terminal (Abstract Book).
2006. 25-25 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
3. Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Buljubašić, Maja; Petranović, Mirjana.
The role of SbcB and SbcCD nucleases in spontaneous DNA degradation in recA mutants of Escherichia coli // Zbornik sažetaka 9. hrvatskog biološkog kongresa s međunarodnim sudjelovanjem / Besendorfer, Višnja ; Klobučar, Goran (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2006. 84-85 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
4. Zahradka, Ksenija; Radman, Miroslav.
DNA repair in Deinococcus radiodurans: from hundreds of fragments to the functional chromosome // Zbornik sažetaka 9. hrvatskog biološkog kongresa s međunarodnim sudjelovanjem / Besendorfer, Višnja ; Klobučar, Goran (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2006. 59-60 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
5. Zahradka, Ksenija; Slade, Dea; Bailone, Adriana; Sommer, Suzanne; Averbeck, Dietrich; Petranović, Mirjana; Lindner, Ariel; Radman, Miroslav.
DNA repair in Deinococcus radiodurans: from hundreds of fragments to the functional chromosomes // Current Trends in Biomedicine Workshop: Mechanism and biological consequences of recombinational DNA repair-mediated genome instability / Aguilera, A. ; Kanaar, R. (ur.).
Baeza, 2006. (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
6. Đermić, Damir; Halupecki, Edyta; Zahradka, Davor; Petranović, Mirjana.
RecBCD Enzyme Overproduction Impairs DNA Repair and Homologous Recombination in Escherichia coli // Book of Abstracts. Second Congress of Croatian Geneticists with International Participation / Franekić Čolić, J. ; Ugarković, Đ. (ur.).
Zagreb : Hrvatsko genetičko društvo, 2005. 88-88 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
7. Džidić, Senka; Tršan, Tihana; Tambić Andrašević, Arjana.
Hypermutability of multiresistant E. coli strains // Book of Abstracts of the Second Congress of Croatian Geneticists / Franekić Čolić, J., Ugarković, Đ. (ur.).
Zagreb : Hrvatsko genetičko društvo, 2005. 56-56 (predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
8. Zahradka, Davor; Buljubašić, Maja; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana.
Effects of a recG Mutation on Homologous Recombination and Recombinational DNA Repair in recBC sbcBC Mutants of Escherichia coli // Book of Abstracts. Second Congress of Croatian Geneticists with International Participation / Franekić Čolić, J. ; Ugarković, Đ. (ur.).
Zagreb : Hrvatsko genetičko društvo, 2005. 84-84 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
9. Zahradka, Ksenija; Bailone, Adriana; Averbeck, Dietrich; Petranović, Mirjana; Radman, Miroslav.
Reconstitution of Deinococcus radiodurans Chromosomes Shattered by Radiation Involves DNA Replication and Recombination // Book of Abstracts. Second Congress of Croatian Geneticists / Franekić Čolić, J. ; Ugarković, Đ. (ur.).
Zagreb : Hrvatsko genetičko društvo, 2005. 55-55 (predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
10. Đermić, Damir; Halupecki, Edyta; Zahradka, Davor; Petranović, Mirjana.
RecBCD enzyme overproduction impairs DNA repair and homologous recombination in Escherichia coli // Zbornik = Proceedings / Treći hrvatski mikrobiološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem, Poreč, 4.-7. listopada 2004. / Balenović, Mirta ; Wittner, Velimir (ur.).
Zagreb : Hrvatsko mikrobiološko društvo, 2004. 87-87 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
11. Trsan, Tihana; Tambić Andrašević, Arjana; Džidić, Senka.
Genetic characterization of multi-resistant mutator strains of E. coli // Zbornik = Proceedings / Treći hrvatski mikrobiološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem, Poreč, 4.-7. listopada 2004. / Balenović, Mirta ; Wittner, Velimir (ur.).
Zagreb : Hrvatsko mikrobiološko društvo, 2004. 85-86 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
12. Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana.
Suppression of cytological defects in recBC sbcBC ruv mutants of Escherichia coli // EMBO Conference on Molecular Microbiology: Exploring Prokaryotic Diversity - Abstract Book / de Lorenzo, Victor ; Toussaint, Ariane ; Bernander, Rolf (ur.).
Heidelberg : EMBL, 2004. 127-127 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
13. Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana.
Cytological defects in recBC sbcBC ruv mutants of Escherichia coli // Zbornik = Proceedings / Treći hrvatski mikrobiološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem, Poreč, 4.-7. listopada 2004. / Balenović, MIrta ; Wittner, Velimir (ur.).
Zagreb : Hrvatsko mikrobiološko društvo, 2004. 88-88 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
14. Zahradka, Ksenija; Bailone, Adriana; Averbeck, Dietrich; Radman, Miroslav.
Reconstitution of Deinococcus radiodurans genome after gamma irradiation // Zbornik = Proceedings / Treći hrvatski mikrobiološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem, Poreč, 4.-7. listopada 2004. / Balenović, Mirta ; Wittner, Velimir (ur.).
Zagreb : Hrvatsko mikrobiološko društvo, 2004. 45-45 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
15. Džidić, Senka; Petranović, Mirjana.
Persisting DNA strand nick could compensate mutH defficiency in Escherichia coli // Biotechnology and Food / Kniewald, Zlatko (ur.).
Zagreb : Hrvatsko Društvo za Biotehnologiju, 2003. 60-60 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
16. Petranović, Dina; Džidić, Senka; Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Petranović, Mirjana.
Activation and inhibition of lambda phage multiplicity reactivation // 2nd Scientific Symposium with International Participation "45 Years of Molecular Biology in Croatia 50 Years of Double Helix", Book of Abstracts / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2003. 23-23 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
17. Petranović, Dina; Zahradka, Ksenija; Zahradka, Davor; Džidić, Senka; Petranović, Mirjana.
Genetic analysis of multiplicity reactivation of UV-irradiated lambda phage // Proceedings of Abstracts of the 8th Croatian Biological Congress / Besendorfer, Višnja ; Kopjar, Nevenka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2003. 45-46 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
18. Zahradka, Davor; Zahradka, Ksenija; Đermić, Damir; Brčić-Kostić, Krunoslav; Petranović, Mirjana.
The RuvABC resolvase is indispensable for recombinational repair in sbcB15 mutants of Escherichia coli // 2nd Scientific Symposium with International Participation "45 Years of Molecular Biology in Croatia 50 Years of Double Helix", Book of Abstracts / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2003. 24-25 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
19. Zahradka, Ksenija; Bailone, Adriana; Averbeck, Dietrich; Radman, Miroslav.
Mechanism of DNA repair in radioresistant bacterium Deinococcus radiodurans // Proceedings of Abstracts of the 8th Croatian Biological Congress / Besendorfer, Višnja ; Kopjar, Nevenka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2003. 47-48 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
20. Zahradka, Ksenija; Bailone, Adriana; Averbeck, Dietrich; Radman, Miroslav.
The mechanism of DNA repair in radioresistant bacterium Deinococcus radiodurans // 2nd Scientific Symposium with International Participation "45 Years of Molecular Biology in Croatia 50 Years of Double Helix", Book of Abstracts / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2003. 25-25 (predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
21. Paškvan, Ivan; Salaj-Šmic, Erika; Ivančić-Baće, Ivana; Zahradka, Ksenija; Lerš, Nella; Brčić-Kostić, Krunoslav.
The genetic dependence of RecBCD-Gam mediated double strand end repair in Escherichia coli // 1 st Croatian Congress on Molecular Life Sciences with international participation, Book of Abstracts / Dumić, Jerka et al. (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2002. 95-95 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
|
|
|
|
|
|
| |
Diplomski radovi
|
| |
1. Šimić, Sanela.
Učinak mutacija sbcB15 i delsbcB na rekombinacijski popravak molekule DNA kod recBC mutanata bakterije Escherichia coli / diplomski rad.
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet, 22.09. 2006.,
75 str. Voditelj: Zahradka, Ksenija.
|
2. Šupak, Vesna.
Učinak mutacije sbcB15 na homolognu rekombinaciju tijekom transdukcije kod bakterije Escherichia coli - hiperrekombinacijski fenotip / diplomski rad.
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet, 10.03. 2006.,
78 str. Voditelj: Zahradka, Davor.
|
3. Buljubašić, Maja.
Učinak mutacije recG na homolognu rekombinaciju u bakteriji Escherichia coli / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 22.02. 2005.,
58 str. Voditelj: Zahradka, Davor.
|
4. Tršan, Tihana.
Povezanost mutatorskog svojstva i višestruke antibiotičke rezistencije u uropatogenim izolatima bakterije Escherichia coli / diplomski rad.
Zagreb : Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 18.04. 2005.,
38 str. Voditelj: Bačun-Družina, Višnja.
|
5. Bratulić, Siniša.
Uloga translezijskih polimeraza u inaktivaciji profaga / diplomski rad.
Zagreb : Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 11.11. 2004.,
28 str. Voditelj: Bačun-Družina, Višnja.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Sadržaj objavljen na bib.irb.hr (osim ako je drugačaije navedeno) podložan je pravilima Creative Commons licence
