|
|
|
|
Autorske knjige
|
|
1. Bornekessel-Schlesewsky, Ina; David, Daniel; Makram, Henry; Pleh, Csaba; Rethelyi, Janos; Tkatchenko, Malgorzata; Ugarković, Đurđica.
The Human Brain - From Cells to Society
.
Strasbourg : Europska znanstvena zaklada (ESF), 2012 (priručnik).
|
|
|
|
|
|
Uredničke knjige
|
|
1.
Long Non-Coding RNAs
/ Ugarković, Đurđica (ur.).
Heidelberg : Springer, 2011 (monografija).
|
2.
Centromere: Structure and Evolution
/ Ugarković, Đurđica (ur.).
Heidelberg : Springer, 2009 (zbornik).
|
3.
Metode u molekularnoj biologiji
/ Ambriović Ristov, Andreja; Brozović, Anamaria; Bruvo Mađarić, Branka; Ćetković, Helena; Herak Bosnar, Maja; Hranilović, Dubravka; Katušić Hećimović, Silva; Meštrović Radan, Nevenka; Mihaljević, Snježana; Slade, Neda; Vujaklija, Dušica (ur.).
Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2007 (priručnik).
|
|
|
|
|
|
Poglavlja u knjizi
|
|
1. Ugarković, Đurđica.
Evolution of Alpha‐Satellite DNA // Encyclopedia of Life Sciences / Hillier, Jennifer (ur.).
Chichester : John Wiley & Sons, 2013..
Str. 1-7.
|
2. Pezer, Željka; Brajković, Josip; Feliciello, Isidoro; Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA-mediated effects on genome regulation // Repetitive DNA / Garrido-Ramos, Manuel (ur.).
Basel : Karger Publishers, 2012.
Str. 153-169.
|
3. Pezer, Željka; Brajković, Josip; Feliciello, Isidoro; Ugarković, Đurđica.
Transcription of satellite DNAs in insects // Long Non-Coding RNAs / Ugarković, Đurđica (ur.).
Heidelberg : Springer, 2011.
Str. 161-178.
|
4. Ugarković, Đurđica.
Centromere-Competent DNA: Structure and Evolution // Centromere: Structure and Evolution / Ugarković, Đurđica (ur.).
Heidelberg : Springer, 2009.
Str. 56-81.
|
5. Ugarković, Đurđica.
Evolution of Alpha Satellite DNA // Encyclopedia of Life Sciences / Bernardes Silva, Martine (ur.).
Chichester : John Wiley & Sons, 2008.
|
6. Hranilović, Dubravka; Pezer, Željka.
Northern analiza // Metode u molekularnoj biologiji / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria ; Bruvo Mađarić, Branka ; Ćetković, Helena ; Herak Bosnar, Maja ; Hranilović, Dubravka ; Katušić Hećimović, Silva ; Meštrović Radan, Nevenka ; Mihaljević, Snježana ; Slade, Neda ; Vujaklija, Dušica (ur.).
Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2007.
Str. 318-325.
|
|
|
|
|
|
Izvorni znanstveni i pregledni radovi u CC časopisima
|
|
1. Feliciello, Isidoro; Akrap, Ivana; Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA Modulates Gene Expression in the Beetle Tribolium castaneum after Heat Stress. // Plos genetics. 11 (2015) , 8; (članak, znanstveni).
|
2. Domazet-Lošo, Tomislav; Klimovich, Alexander; Anokhin, Borsi; Anton-Erxleben, Friederike; Hamm, Maillin J.; Lange, Christina; Bosch, Thomas C.G.
Naturally occurring tumours in the basal metazoan Hydra. // Nature Communications. 5 (2014) ; 4222-4230 (članak, znanstveni).
|
3. Feliciello, Isidoro; Akrap, Ivana; Brajković, Josip; Zlatar, Ivo; Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA as a driver of population divergence in the red flour beetle Tribolium castaneum. // Genome biology and evolution. 7 (2014) , 1; 228-239 (članak, znanstveni).
|
4. Podnar, Martina; Bruvo Mađarić, Branka; Mayer, Werner.
Non-concordant phylogeographical patterns of three widely codistributed endemic Western Balkans lacertid lizards (Reptilia, Lacertidae) shaped by specific habitat requirements and different responses to Pleistocene climatic oscillations. // Journal of zoological systematics and evolutionary research. 52 (2014) , 2; 119-129 (članak, znanstveni).
|
5. Bruvo Mađarić, Branka; Mičetić Stanković, Vlatka; Čorak, Luka; Ugarković, Đurđica; Komarek, Albrecht.
Contributions to molecular systematics of water scavenger beetles (Hydrophilidae, Coleoptera). // Journal of zoological systematics and evolutionary research. 51 (2013) , 2; 165-171 (članak, znanstveni).
|
6. de Mendoza, A.; Sebé-Pedrós, A.; Šestak, Martin Sebastijan; Matejčić, Marija; Torruella, G.; Domazet-Lošo, Tomislav; Ruiz-Trillo, I.
Transcription factor evolution in eukaryotes and the assembly of the regulatory toolkit in multicellular lineages. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (2013) , 50; E4858-E4566 (članak, znanstveni).
|
7. McFall-Ngai, Margaret; Hadfield, Michael G.; Bosch, Thomas C.G.; Carey, Hannah V.; Domazet-Lošo, Tomislav; ...; Wernegreen, Jennifer J.
Animals in a bacterial world, a new imperative for the life sciences. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (2013) , 9; 3229-3236 (pregledni rad, znanstveni).
|
8. Šestak, Martin Sebastijan; Božičević, Vedran; Bakarić, Robert; Dunjko, Vedran; Domazet-Lošo, Tomislav.
Phylostratigraphic profiles reveal a deep evolutionary history of the vertebrate head sensory systems. // Frontiers in Zoology. 10 (2013) ; 18-18 (članak, znanstveni).
|
9. Hemmrich, G.; Khalturin, K.; Boehm, A.M.; Puchert, M.; Anton-Erxleben, F.; Wittlieb, J.; Klostermeier, U.C.; Rosenstiel, P.; Oberg H.H.; Domazet-Lošo, Tomislav; Sugimoto, T.; Niwa, H.; Bosch, T.C.
Molecular signatures of the three stem cell lineages in hydra and the emergence of stem cell function at the base of multicellularity. // Molecular biology and evolution. 29 (2012) , 11; 3267-3280 (članak, znanstveni).
|
10. Zhang G.; Fang X.; Guo X.; Li, L.; Luo, R.; Xu, F.; Yang, P.; Zhang, L.; Wang, X.; Qi, H.; Xiong, Z.; Que, H.; Xie, Y.; Holland, P.W.; Paps, J.; Zhu, Y.; Wu, F.; Chen, Y.; Wang, J.; Peng, C.; Meng, J.; Yang, L.; Liu, J.; Wen, B.; Zhang, N.; Huang, Z.; Zhu, Q.; Feng, Y.; Mount, A.; Hedgecock, D.; Xu, Z.; Liu, Y.; Domazet-Lošo, Tomislav; Du, Y.; et. al.
The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation. // Nature. 490 (2012) , 7418; 49-54 (članak, znanstveni).
|
11. Diethard, Tautz; Domazet-Lošo, Tomislav.
The evolutionary origin of orphan genes. // Nature reviews genetics. 12 (2011) , 10; 692-702 (članak, znanstveni).
|
12. Feliciello, Isidoro; Chinali, Gianni; Ugarković, Đurđica.
Structure and population dynamics of the major satellite DNA in the red flour beetle Tribolium castaneum. // Genetica ('s-Gravenhage). 139 (2011) , 8; 999-1008 (članak, znanstveni).
|
13. Domazet-Lošo, Tomislav; Tautz, Diethard.
A phylogenetically based transcriptome age index mirrors ontogenetic divergence patterns. // Nature. 468 (2010) , 7325; 815-818 (pismo, znanstveni).
|
14. Harcet, Matija; Bilandžija, Helena; Bruvo Mađarić, Branka; Ćetković, Helena.
Taxonomic position of Eunapius subterraneus (Porifera, Spongillidae) inferred from molecular data - a revised classification needed?. // Molecular phylogenetics and evolution. 54 (2010) , 3; 1021-1027 (članak, znanstveni).
|
15. Pezer, Željka; Ugarković, Đurđica.
Transcription of Pericentromeric Heterochromatin in Beetles - Satellite DNAS as Active Regulatory Elements. // Cytogenetic and genome research. 124 (2009) , 3/4; 274-283 (članak, znanstveni).
|
16. Domazet-Lošo, Tomislav; Tautz, D.
An Ancient Evolutionary Origin of Genes Associated with Human Genetic Diseases. // Molecular biology and evolution. 25 (2008) , 12; 2699-2707 (članak, znanstveni).
|
17. Pezer, Željka; Ugarković, Đurđica.
Role of non-coding RNA and heterochromatin in aneuploidy and cancer. // Seminars in cancer biology. 18 (2008) , 2; 123-130 (članak, znanstveni).
|
18. Bruvo-Mađarić, Branka; Plohl, Miroslav; Ugarković, Đurđica.
Wide distribution of related satellite DNA families within the genus Pimelia (Tenebrionidae). // Genetica. 130 (2007) ; 35-42 (članak, znanstveni).
|
19. Domazet-Lošo, Tomislav; Brajković, Josip; Tautz, Diethard.
A phylostratigraphy approach to uncover the genomic history of major adaptations in metazoan lineages. // Trends in Genetics. 23 (2007) , 11; 533-539 (članak, znanstveni).
|
|
|
|
|
|
Znanstveni radovi u drugim časopisima
|
|
1. Feliciello, Isidoro; Parazajder, Josip; Akrap, Ivana; Ugarković, Đurđica.
First evidence of DNA methylation in insect Tribolium castaneum: Environmental regulation of DNA methylation within heterochromatin. // Epigenetics. 8 (2013) , 5; 534-541 (članak, znanstveni).
|
2. Brajković, Josip; Feliciello, Isidoro; Bruvo-Mađarić, Branka; Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA-Like Elements Associated With Genes Within Euchromatin of the Beetle Tribolium castaneum. // G3: Genes, Genomes, Genetics. 2 (2012) , 8; 931-941 (članak, znanstveni).
|
3. Pezer, Željka; Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA-associated siRNAs as mediators of heat shock response in insects. // RNA Biology. 9 (2012) , 5; 587-595 (članak, znanstveni).
|
4. Domazet-Lošo, Tomislav; Tautz Diethard.
Phylostratigraphic tracking of cancer genes suggests a link to the emergence of multicellularity in metazoa. // Bmc biology. 8 (2010) ; 66-66 (članak, znanstveni).
|
5. Pezer, Željka; Ugarković, Đurđica.
RNA Pol II Promotes Transcription of Centromeric Satellite DNA in Beetles. // PLoS ONE. 3 (2008) ; (članak, znanstveni).
|
|
|
|
|
|
Ostali radovi u drugim časopisima
|
|
|
|
|
Drugi radovi u zbornicima skupova s recenzijom
|
|
1. Brajković, Josip; Pezer, Željka; Feliciello, Isidoro; Bruvo-Mađarić, Branka; Ugarković, Đurđica.
The role of satellite DNA in insect genome regulation and evolution // Bioinformatics and biological phycics ; proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb : Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. 3-7 (predavanje,domaća recenzija,objavljeni rad,znanstveni).
|
|
|
|
|
|
Sažeci u zbornicima skupova
|
|
1. Feliciello, Isidoro; Akrap, Ivana; Brajković, Josip; Pezer, Željka; Ugarković, Đurđica.
Dispersed satellite DNA elements and their effect on gene expression // Epigenesys: 3rd Annual Meeting / Reik, Wolf (ur.).
Cambridge : Cambridge University Press, 2013. 94-94 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
2. Ugarković, Đurđica.
O čemu nam govore genomi kukaca? // .
(pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
3. Pezer, Željka; Feliciello, Isidoro; Parazajder, Josip; Ugarković, Đurđica.
DNA demethylation and heterochromatin remodelling upon heat stress // .
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
4. Brajković, Josip; Feliciello, Isidoro; Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA-like elements dispersed within euchromatin of beetle Tribolium castaneum // .
(poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
5. Feliciello, Isidoro; Brajković, Josip; Ugarković, Đurđica.
First evidence of CpG methylation in genomic DNA of Tribolium castaneum embryos // .
(predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
6. Ugarković, Đurđica; Pezer, Željka.
Environmental stimuli induce remodelling of heterochromatin in insects // .
(poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
7. Ugarković, Đurđica.
Environmental stimuli induce remodelling of heterochromatin in insects // BIT's 2nd Annual World Congress of Molecular & Cell Biology - 2012 / Judy Du (ur.).
Peking : BIT Congress Inc., 2012. 44-44 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
8. Bruvo Mađarić, Branka; Pezer, Željka; Pons, Joan; Ugarković, Đurđica.
PHYLOGENY OF COLEOPTERA: DEVELOPMENT OF NEW MOLECULAR MARKERS // .
(predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
9. Čorak, Luka; Mičetić Stanković, Vlatka; Bruvo Mađarić, Branka.
Water scavenger beetles (Hydrophilidae, Coleoptera) of Croatia: phylogenetic analysis using mitochondrial markers // .
(poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
10. Ugarković, Đurđica.
Developmental and environmental regulation of heterochromatin transcription // .
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
11. Ugarković, Đurđica.
Transcription of Satellite DNAs and Genome Regulation in Insects // .
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
12. Pezer, Željka; Brajković, Josip; Ugarković, Đurđica.
Transcription of satellite DNAs and genome regulation in Tribolium beetles // The Non-coding Genome.
2010. 258-258 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
13. Pezer, Željka; Dumbović, Gabrijela; Milutinović, Barbara; Ugarković, Đurđica.
Transcription of pericentromeric heterochromatin in beetles – satellite DNAs as active regulatory elements // The EMBO Meeting 2009 - Abstracts / EMBO (ur.).
Amsterdam : European Molecular Biology Organization (EMBO), 2009. 53-54 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
14. Ugarković, Đurđica.
Evolution of centromere // Međunarodni simpozij Darwin 2009.- zbornik sažetaka / Kućan, Ž. ; Gušić, I. ; Rudan P. (ur.).
Zagreb : Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2009. 21-22 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
15. Pezer, Ž.; Brajković, J.; Beer, Z.; Ugarković, Đ.
RNA Pol II Promotes Transcription of Centromeric Satellite DNAs in Beetles // 4th Annual Meeting EU FP6 programme The Epigenome - Network of Excellence (2004-2009) / The Epigenome - Network of Excellence (ur.).
Madrid : CNIO, 2008. 38-38 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
16. Pezer, Željka; Brajković, Josip; Beer, Zsuzsanna, Ugarković, Đurđica.
RNA Pol II promotes transcription of centromeric satellite DNA in beetles // 4th Annual Meeting EU 6th FP The Epigenome, Network of Excellence / Linderson, Ylva ; Bertrand, Sara (ur.).
Madrid : Centro Nacional de Investigaciones Oncologicas, 2008. 85-85 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
17. Pezer, Željka; Brajković, Josip; Beer, Z.; Ugarković, Đurđica.
RNA Pol II Promotes Transcription of Centromeric Satellite DNAs in Beetles // 50 Godina molekularne biologije u Hrvatskoj - zbornik sažetaka / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja (ur.).
Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008. 21-21 (predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
18. Pezer, Željka; Ugarković, Đurđica.
Transcriptional analysis of evolutionarily conserved PRAT satellite DNA in the beetle Palorus ratzeburgii // 3rd Annual Meeting EU 6th Framework Programme The Epigenome - Network of Excellence - book of Abstracts / Jenuwein Thomas (ur.).
Stockholm : The Epigenome, 2007. 81 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
19. Ugarković, Đurđica.
PostGenetics Medicine // PharmaCon 2007 - European Student's Congress on Future of Pharmacy - Book of Abstracts / Baričević, Hilarije ; Takač, Vedran (ur.).
Zagreb : CROPBSA, 2007. 33 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
20. Ugarković, Đurđica.
Satellite DNA and centromere evolution // Bio-Math Workshop: Mining and Meaning: Repetitive DNA in the Genomic Era - Book of Abstracts / Heslop-Harrison, Pat (ur.).
Leicester : University of Leicester, 2007. 1 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
|
|
|
|
|
Neobjavljena sudjelovanja na skupovima
|
|
1. Brajković, Josip.
Svojstva i rasprostranjenost TCAST satelitne DNA u eukromatinu vrste Tribolium castaneum i njena moguća uloga u genskoj ekspresiji // .
(pozvano predavanje,ppt prezentacija,znanstveni).
|
2. Ugarković, Đurđica.
Evolucija vrsta zapisana u molekuli DNK // .
(pozvano predavanje,domaća recenzija,neobjavljeni rad,znanstveni).
|
3. Ugarković, Đurđica.
Budućnost ljudske evolucije // .
(pozvano predavanje,domaća recenzija,ppt prezentacija,znanstveni).
|
4. Ugarković, Đurđica.
Prikaz uspješnog FP6 Marie Curie projekta (Transfer of Knowledge): NonCodDNA - Structural and functional analysis of noncoding heterochromatic DNA in insect Tribolium castaneum // .
(pozvano predavanje,domaća recenzija,neobjavljeni rad,stručni).
|
5. Ugarković, Đurđica.
Evolucija zapisana u molekuli DNA // .
(pozvano predavanje,neobjavljeni rad).
|
6. Ugarković, Đurđica.
FP6 Marie Curie projekti - iskustva i preporuke // Info dan "FP7 - People" program (Marie Curie Actions).
(pozvano predavanje,neobjavljeni rad,stručni).
|
7. Ugarković, Đurđica.
FP Mobility - Marie Curie RTN Experience // Forschung Austria Workshop: Researchers Mobility in the European Region Adria-Alpe-Pannonia: Challenges, Opportunities and Initiatives.
2008. (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,ppt prezentacija,stručni).
|
|
|
|
|
|
Disertacije
|
|
1. Šestak, Martin Sebastijan.
Phylostratigraphic analysis of the macroevolutionary history of organ systems in animals / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički, 14.06. 2013.,
157 str. Voditelj: Domazet-Lošo, Tomislav.
|
2. Brajković, Josip.
Svojstva i rasprostranjenost TCAST satelitne DNA u eukromatinu vrste Tribolium castaneum i njena moguća uloga u genskoj ekspresiji / doktorska disertacija.
Zagreb : Poslijediplomski interdisciplinarni doktorski studij Molekularne bioznanosti, 15.11. 2012,
87 str. Voditelj: Ugarković, Đurđica.
|
3. Pezer, Željka.
Transcription of pericentromeric heterochromatin in Palorus beetles - satellite DNAs as active regulatory elements / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički, 23.03. 2010,
53 str. Voditelj: Ugarković, Đurđica.
|
|
|
|
|
|
Diplomski radovi
|
|
1. Akrap, Ivana.
Study of satellite DNA-mediated gene regulation in red flour beetle Tribolium castaneum (Herbst, 1797) / završni rad - diplomski/integralni studij.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički, 11.02. 2013.,
52 str. Voditelj: Ugarković, Đurđica.
|
2. Dumbović, Gabrijela.
Razvijanje metode imunofluorescencije na kromosomima vrste Tribolium castaneum Herbst. (Coleoptera) / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički, 16.06. 2010,
55 str. Voditelj: Đurđica Ugarković.
|
3. Milutinović, Barbara.
Imunofluorescencija na kromosomima brašnara Tenebrio molitor L. / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički, 10.06. 2009.,
40 str. Voditelj: Ugarković, Đurđica.
|
4. Vuk, Maja.
Transkripcija satelitne DNA kod kukaca Tribolium castaneum (Herbst, 1797) i Tribolium brevicornis (LeConte, 1859), Coleoptera / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički, 21.03. 2007.,
51 str. Voditelj: Ugarković, Đurđica.
|
|
|
|
|
|
|