crta
Hrvatska znanstvena Sekcija img
bibliografija
3 gif
 Naslovna
 O projektu
 FAQ
 Kontakt
4 gif
Pregledavanje radova
Jednostavno pretraživanje
Napredno pretraživanje
Skupni podaci
Upis novih radova
Upute
Ispravci prijavljenih radova
Ostale bibliografije
Slični projekti
 Bibliografske baze podataka

Razvoj i primjene principa maksimalne proizvodnje entropije
(177-1770495-0476)

 
 
 
Verzija za printanje   
 
  Poglavlja u knjizi
 

1. Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Brumen, Milan; Juretić, Davor.
Maximum Entropy Production and Maximum Shannon Entropy as Germane Principles for the Evolution of Enzyme Kinetics // Beyond the Second Law: Entropy Production and Non- equilibrium Systems / Dewar, Roderick C ; Charles ; Lineweaver, Charles H ; Niven, Robert K ; Regenauer-Lieb, Klaus (ur.).
Berlin : Springer-Verlag, 2014. Str. 361-382.

2. Juretić, Davor.
Personal Impressions about Ante During almost 50 Years of Contacts with Him // Ante Graovac - Life and Works / Gutman, Ivan ; Pokrić, Biserka ; Vukičević, Damir (ur.).
Kragujevac, Srbija : University of Kragujevac and Faculty of Science Kragujevac, 2014. Str. 139-140.

3. Juretić, Davor; Tossi, Alessandro; Kamech, Nédia; Ilić, Nada; Bojović, Viktor; Novković, Mario; Simunić, Juraj; Petrov, Dražen; Lučić, Bono; Miljak, Marija; Ivica, Josip; Kozić, Mara; Vukičević, Damir.
From Data Collecting to Web servers for Automatic Design of Peptide Antibiotics // Bioinformatics and biological physics : proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb : Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti, 2013. Str. 63-78. prilozen text rada
Vrh
 
  Izvorni znanstveni i pregledni radovi u CC časopisima
 

1. Simunić, Juraj; Petrov, Dražen; Bouceba, Tahar; Kamech, Nédia; Benincasa, Monica; Juretić, Davor.
Trichoplaxin — A new membrane-active antimicrobial peptide from placozoan cDNA. // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes. 1838 (2014) , 5; 1430-1438 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

2. Ilić, Nada; Novković, Mario; Guida, Filomena; Xhindoli, Daniela; Benincasa, Monica; Tossi, Alesandro; Juretić, Davor.
Selective antimicrobial activity and mode of action of adepantins, glycine-rich peptide antibiotics based on anuran antimicrobial peptide sequences. // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes. 1828 (2013) , 3; 1004-1012 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

3. Kuić, Domagoj.
Quantum Mechanical Virial Theorem in Systems with Translational and Rotational Symmetry. // International journal of theoretical physics. 52 (2013) , 4; 1221-1239 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

4. Kamech, Nédia; Vukičević, Damir; Ladram, Ali; Piesse, Christophe; Vasseur, Julie; Bojović, Viktor; Simunić, Juraj; Juretić, Davor.
Improving the Selectivity of Antimicrobial Peptides from Anuran Skin. // Journal of chemical information and modeling. 52 (2012) , 12; 3341-3351 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

5. Kuić, Domagoj; Županović, Paško; Juretić, Davor.
Macroscopic Time Evolution and MaxEnt Inference for Closed Systems with Hamiltonian Dynamics. // FOUNDATIONS OF PHYSICS. 42 (2012) , 2; 319-339 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

6. Novković, Mario; Simunić, Juraj; Bojović, Viktor; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor.
DADP: the database of anuran defense peptides. // Bioinformatics. 28 (2012) , 10; 1406-1407 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

7. Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Brumen, Milan; Bonačić-Lošić, Željana; Kuić, Domagoj; Juretić, Davor.
Enzyme kinetics and the maximum entropy production principle. // Biophysical chemistry. 154 (2011) , 2/3; 49-55 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

8. Janowska, Maria K.; Zubac, Ruben; Žagrović, Bojan.
Computational Analysis of Binding of the GBD Domain of WASP to Different Binding Partners. // Croatica chemica acta. 84 (2011) , 2; 211-220 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

9. Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Petrov, Dražen; Novković, Mario; Bojović, Viktor; Lučić, Bono; Ilić, Nada; Tossi, Alessandro.
Knowledge-based computational methods for identifying or designing novel, non-homologous antimicrobial peptides. // European biophysics journal. 40 (2011) , 4; 371-385 (pregledni rad, znanstveni). URL link to workURL link to work

10. Kuzmanić, Antonija; Kruschel, Daniela; van Gunsteren, Wilfred; Pannu, Navraj; Žagrović, Bojan.
Dynamics may significantly influence the estimation of interatomic distances in biomolecular X-ray structures.. // Journal of molecular biology. 411 (2011) , 1; 286-297 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

11. Petrov, Dražen; Žagrović, Bojan.
Microscopic Analysis of Protein Oxidative Damage : Effect of Carbonylation on Structure, Dynamics, and Aggregability of Villin Headpiece. // Journal of the American Chemical Society. 133 (2011) , 18; 7016-7024 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

12. Šimunović, Mijo; Žagrović, Bojan; Tomić, Sanja.
Mechanism and thermodynamics of ligand binding to auxin amidohydrolase. // Journal of molecular recognition. 24 (2011) , 5; 854-861 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

13. Kuzmanić, Antonija; Žagrović, Bojan.
Determination of ensemble-average pairwise root-mean square deviation from experimental B-factors. // Biophysical journal. 98 (2010) , 5; 861-871 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

14. Marčelja, Stjepan.
The timescale and extent of thermal expansion of the global ocean due to climate change. // Ocean science. 6 (2010) , 1; 179-184 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

15. Županović, Paško; Botrić, Srećko; Juretić, Davor; Kuić, Domagoj.
Relaxation processes and the maximum entropy production principle. // Entropy (Basel. Online). 12 (2010) , 3; 473-479 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

16. Županović, Paško; Brumen, Milan; Jagodič, Marko; Juretić, Davor.
Bacterial chemotaxis and entropy production. // Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 365 (2010) ; 1397-1403 (članak, znanstveni). URL link to work

17. Županović, Paško; Kuić, Domagoj; Bonačić Lošić, Željana; Petrov, Dražen; Juretić, Davor; Brumen, Milan.
The maximum entropy production principle and linear irreversible processes. // Entropy (Basel. Online). 12 (2010) , 5; 996-1005 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

18. Županović, Paško; Kuić, Domagoj; Juretić, Davor; Dobovišek, Andrej.
On the problem of formulating principles in nonequilibrium thermodynamics. // Entropy (Basel. Online). 12 (2010) , 4; 926-931 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

19. Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro.
Computational Design of Highly Selective Antimicrobial Peptides. // Journal of chemical information and modeling. 49 (2009) , 12; 2873-2882 (članak, znanstveni). prilozen text radaURL link to workURL link to work

20. Kruschel, Daniela; Žagrović, Bojan.
Conformational averaging in structural biology : issues, challenges and computational solutions. // Molecular biosystems. 5 (2009) , 12; 1606-1616 (pregledni rad, znanstveni). URL link to work

21. Muller, C.L.; Sbalzarini, I.F.; van Gusteren, W.F.; Žagrovic, Bojan; Hunenberger, P.H.
In the eye of the beholder : inhomogeneous distribution of high-resolution shapes within the random-walk ensemble. // Journal of Chemical Physics. 130 (2009) , 21; 214904-1-214904-25 (članak, znanstveni).

22. Wlodarski, Tomasz; Žagrović, Bojan.
Conformational selection and induced fit mechanism underlie specificity in noncovalent interactions with ubiquitin. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (2009) , 46; 19346-19351 (članak, znanstveni). prilozen text radaURL link to workURL link to work

23. Schwab, F.; van Gusteren, W.F.; Žagrović, Bojan.
Computational study of the mechanism and the relative free energies of binding of anticholesteremic inhibitors to squalene-hopene cyclase. // Biochemistry. 47 (2008) , 9; 2945-2951 (članak, znanstveni).

24. Žagrović, Bojan; Đikić, Ivan.
Childhood of a phoenix : modern biology in Eastern and South-Eastern Europe. // Nature Reviews Molecular Cell Biology. 9 (2008) , 4; 333-336 (pregledni rad, stručni). URL link to work

25. Žagrović, Bojan; Gattin, Zrinka; Lau, J.K.; Huber, M.; van Gunsteren, W.F.
Structure and dynamics of two beta-peptides in solution from molecular dynamics simulations validated against experiment. // European Biophysics Journal. 37 (2008) , 6; 903-912 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

26. Schmid, Nathan; Žagrović, Bojan; van Gunsteren, Wilfred F.
Mechanism and thermodynamics of binding of the polypyrimidine tract binding protein to RNA. // Biochemistry. 46 (2007) , 22; 6500-6512 (članak, znanstveni). URL link to work

27. Schmid, Nathan; Žagrović, Bojan; van Gunsteren, Wilfred F.
Folding-unfolding equilibrium of a methylidene-substituted beta-peptide. // Helvetica chimica acta. 90 (2007) , 10; 1966-1979 (članak, znanstveni). URL link to work

28. Žagrović, Bojan.
Helical signature motif in the fibre diffraction patterns of random-walk chains. // Molecular physics. 105 (2007) , 10; 1299-1306 (članak, znanstveni). URL link to work

29. Žagrović, Bojan; van Gunsteren, Wilfred F.
Computational analysis of the mechanism and thermodynamics of inhibition of phosphodiesterase 5A by synthetic ligands. // Journal of chemical theory and computation. 3 (2007) , 1; 301-311 (članak, znanstveni). URL link to work
Vrh
 
  Znanstveni radovi u drugim časopisima
 

1. Awile, Omar; Kriško, Anita; Sbalzarini, Ivo; Žagrović, Bojan.
Intrinsically Disordered Regions May Lower the Hydration Free Energy in Proteins: A Case Study of Nudix Hydrolase in the Bacterium Deinococcus radiodurans. // Plos computational biology. 6 (2010) , 7; 1-10 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

2. Hlevnjak, Mario; Žitković, Gordan; Žagrović, Bojan.
Hydrophilicity Matching – A Potential Prerequisite for the Formation of Protein-Protein Complexes in the Cell. // PLoS ONE. 5 (2010) , 6; 1-8 (članak, znanstveni). URL link to workURL link to work

3. Plavčić, Miro; Županović, Paško; Bonačić Lošić, Željana.
The resonance of the Wilberforce pendulum and the period of beats. // Latin-American Journal of Physics Education. 3 (2009) , 3; 547-549 (članak, znanstveni). URL link to work
Vrh
 
  Ostali radovi u drugim časopisima
 

1. Juretić, Davor.
Dragulj Erwina Schrodingera: Što je život. // Priroda. 9 (2007) ; 26-30 (članak, stručni).

2. Juretić, Davor.
Osobitosti znanstvene metode istraživanja prirode. // Dijalog: Časopis za društveno - duhovna propitivanja i oglede. 7 (2007) ; 37-40 (članak, stručni).
Vrh
 
  Kongresno priopćenje (sažeci) u CC časopisu
 

1. Dobovišek, Andrej; Brumen, Milan; Županović, Paško; Juretić, Davor.
Maximum entropy production principle (MEPP) in generalized Michaelis-Menten kinetics // Abstracts of the 7th EBSA European Biophysics Congress ; u: European biophysics journal 38 (2009) (S1) ; S35–S212 ; Statistical, soft matter and biological physics ; P-330.
Heideleberg : Springer, 2009. S121-S121 (poster,sažetak,znanstveni). URL link to work
Vrh
 
  Plenarna izlaganja
 

1. Juretić, Davor.
Bioinformatics of Antimicrobial Peptides: From Collecting Data to Web Servers for Automatic Design of Peptide Antibiotics // HRVATSKA AKADEMIJA ZNANOSTI I UMJETNOSTI: NOVA DOSTIGNUĆA HRVATSKIH ZNANSTVENIKA IZ BIOINFORMATIKE I BIOLOŠKE FIZIKE / Paar, Vladimir (ur.).
2013. (plenarno predavanje,sažetak,znanstveni).
Vrh
 
  Sažeci u zbornicima skupova
 

1. Juretić, Davor.
Host defense peptides as natural product scaffolds for a design of next generation antibiotic classes // Proceedings of the First Adriatic Symposium on Biophysical Approaches in Biomedical Studies / Raguž, Marija ; Kalyanaraman, Balaraman ; Sarna, Tadeusz ; Ilić, Nada ; Nejašmić, Danijel ; Thelaner, Jane (ur.).
Split : Mediterranean Institute for Life Sciences (MedILS), 2014. 53-53 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

2. Raguž, Marija; Ilić, Nada; Kumar, Suresh; Zareba, Mariusz; Mainali, Laxman; Subczynski, Karol.
Colesterol Bilayer Domain in Phospholipid Bilayer Membranes Can be Detected by Confocal Microscope // Proceedings of the First Adriatic Symposium on Biophysical Approaches in Biomedical Studies / Raguž, Marija ; Kalyanaraman, Balaraman ; Sarna, Tadeusz ; Ilić, Nada ; Nejašmić, Danijel ; Thelaner, Jane (ur.).
Split : Mediterranean Institute for Life Sciences (MedILS), 2014. 69-69 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

3. Županović, Paško; Juretić, Davor.
THE RELEVANCE OF MAXIMUM ENTROPY PRODUCTION PRINCIPLE AND MAXIMUM INFORMATION ENTROPY PRINCIPLE IN BIOLOGY // From Basic to Life Sciences 7 / Pavuna, Davor (ur.).
2014. (predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

4. Županović, Paško; Juretić, Davor.
The relevance of maximum entropy production principle and maximum information entropy principle in biology // Proceedings / Piloteelli, Mariagrazia ; Beretta, Gian Paolo (ur.).
Brescia : Cartolibreria Snoopy, 2013. 94-98 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

5. Županović, Paško; Sorić, Ivica; Sorić, Tomislav.
Stirling engine as simple as possible // Proceedings / Piloteelli, Mariagrazia ; Beretta, Gian Paolo (ur.).
Brescia : Cartolibreria Snoopy, 2013. 510-513 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

6. Ilić, Nada; Novković, Mario; Guida, Filomena; Xhindoli, Daniela; Benincasa, Monica; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor.
Adepantins, computationally designed, glycine-rich peptide antibiotics, with low toxicity and very high G- selectivity // New Antimicrobials Workshop in Trieste, 25-26.5.2012 / Tossi, Alessandro (ur.).
Trieste : Edizioni Universita di Trieste, 2012. 37-38 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

7. Juretić, Davor.
Peptide antibiotics: do they have a future or not? // From Solid State to BioPhysics VI / Pavuna, Davor (ur.).
2012. (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

8. Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Novković, Mario; Simunić, Juraj; Bojović, Viktor; Kamech, Nédia; Tossi, Alessandro.
In silico search strategies for finding new AMPs // New Antimicrobials Workshop in Trieste, 25-26.5.2012 / Tossi, Alessandro (ur.).
Trst : Edizioni Universita di Trieste, 2012. 23-24 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

9. Novković, Mario; Simunić, Juraj; Bojović, Viktor; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor.
DADP: the Database of Anuran Defense Peptides // New Antimicrobials Workshop in Trieste, 25-26.5.2012 / Tossi, Alessandro (ur.).
Trieste : Edizioni Universita di Trieste, 2012. 39-40 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

10. Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Brumen, Milan; Bonačić-Lošić, Željana; Kuić, Domagoj; Juretić, Davor.
Kinetika enzima i načelo najvećeg nastajanja entropije // Knjiga sažetaka, VII Znanstveni sastanak HFD-a Primošten, 13-16 listopada 2011.
Zagreb, 2011. 136-136 (poster,sažetak,znanstveni).

11. Kuić, Domagoj; Županović, Paško; Juretić, Davor.
Algoritam maksimalne entropije i vremenska evolucija zatvorenih makroskopskih sustava s Hamiltonovom dinamikom // Knjiga sažetaka, VII Znanstveni sastanak HFD-a Primošten, 13-16 listopada 2011.
Zagreb, 2011. 133-133 (poster,sažetak,znanstveni).

12. Juretić, Davor.
Structural asymmetries and biological activity of membrane-transforming-peptides // Book of Abstracts: Visualization and modeling in Chemistry.
Split (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

13. Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Kuić, Domagoj; Bonačić-Lošić, Željana; Brumen, Milan; Juretić, Davor.
Evolutionary optimization of enzymatic reactions by Maximum Entropy Production Principle // Book of Abstracts, Regional Biophysics Conference , Primošten , 15-18 September 2010.
Zagreb, 2010. 31-31 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

14. Hlevnjak, Mario; Wlodarski, Tomasz; Zitkovic Gordan, Zagrovic, Bojan.
Computational biophysics of macromolecules: protein-protein interactions in a crowded cell // Book of Abstracts AMP2012.
Zagreb, 2010. 27-27 (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

15. Ilić, Nada; Novković, Mario; Guida, Filomena; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro; Copić, Tea; Puizina, Jasna; Juretić, Davor.
Adepantins, a new class of ab-initio designed antimicrobial peptides // Book of Abstracts AMP2010 / Juretić, Davor ; Separovic, Frances (ur.).
Split : Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2010. 41-41 (poster,sažetak,znanstveni).

16. Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Petrov, Dražen; Novković, Mario; Ilić, Nada; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro.
Computational methods for using known antimicrobial peptide sequences to identify or design novel non-homologous peptides // Book of Abstracts AMP2010 / Juretić, Davor ; Separovic, Frances (ur.).
Split : Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2010. 20-20 (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

17. Kuić, Domagoj; Županović, Paško.
Introduction of MaxEnt algorithm to Hamiltonian dynamics of classical macroscopic closed systems // Workshop programme and abstracts.
Jena, 2010. 19-19 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

18. Lučić, Bono; Bojović, Viktor; Vukičević, Damir; Juretić, Davor.
Positional specific amino acid attributes improve the computational design of antimicrobial peptides // Australia-Croatia Workshop on Antimicrobial Peptides and Summer School in Biophysics in Biophysics (AMP2010) : Book of Abstracts / Juretić, Davor ; Šeparović, Frances (ur.).
Split : Faculty of Sciences, 2010. 43-43 (poster,sažetak,znanstveni).

19. Petrov, Dražen; Juretić, Davor.
Conserved signal sequences specific for processing of innate immunity antimicrobial peptides // Book of Abstracts AMP2010 / Juretić, Davor ; Separovic, Frances (ur.).
Split : Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2010. 47-47 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

20. Županović, Paško; Brumen, Milan; Fajmut, Aleš; Juretić, Davor.
Negative pressure in osmosis at constant volume and water uptake in tall tree // Book of Abstracts.
Zagreb, 2010. 49-49 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

21. Županović, Paško; Brumen, Milan; Kuić, Domagoj; Fajmut, Aleš; Juretić, Davor.
The effect of the elasticity of membrane on the stability of the solvent in osmotic process at constant volume // Workshop programme and abstracts.
Jena, 2010. 18-18 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

22. Plavčić, Miro; Županović, Paško.
Wilberforceov oscilator // Knjiga sažetaka 6. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva, Zagreb, 2009.
Zagreb 142-142 (poster,sažetak,znanstveni).

23. Paško Županović; Domagoj Kuić, Milan Brumen; Aleš Fajmut; Davor Juretić.
Osmotic process at constant volume and ascent of sap in xylem // Maximum Entropy Production in the Earth Systems, Jena, Germany, 2009..
(predavanje,sažetak,znanstveni).

24. Brumen, Milan; Fajmut, Aleš; Juretić, Davor; Kuić, Domagoj; Županović, Paško.
The significance of the xylem-phloem coupling in the upward water transport in plants // Regional Biophysics Conference 2009, Linz, Austria, February 2009.
(poster,sažetak,znanstveni). URL link to work

25. Dobovišek, Andrej; Kuić, Domagoj; Bonačić Lošić, Željana; Brumen, Milan; Županović, Paško; Juretić, Davor.
Entropy production in enzymatic reactions // Regional Biophysics Conference 2009, Linz, Austria, February 2009.
(poster,sažetak,znanstveni). URL link to work

26. Žagrović, Bojan.
Natively unfolded regions lower the solvation free energy in proteins: a putative role in the desiccation-resistant bacterium Deinococcus radiodurans // Regional Biophysics Conference, Linz, Austria, February 2009.
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni). URL link to work

27. Zagrović, Bojan.
More dynamic than we think? Conformational averaging in structural biology // CCPB Biomolecular Simulation conference, York, UK, January 2009.
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni). URL link to work

28. Dobovišek, Andrej; Kuić, Domagoj; Bonačić Lošić, Željana; Brumen, Milan; Županović, Paško; Juretić, Davor.
Entropy production and Shannon's entropy in enzymatic reactions // Maximum Entropy Production in the Earth Systems, Jena, Germany, 2009.
Jena, 2009. 18-18 (poster,sažetak,znanstveni).

29. Hlevnjak, Mario; Zagrovic, Bojan.
Non-specific component of protein-protein interactions // 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja: Smith, David (ur.).
Zagreb : Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. 57-57 (poster,sažetak,znanstveni).

30. Juretić, Davor.
Selectivity prediction for frog-type peptide antibiotics against Gram-negative bacteria // The 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja ; Smith, David (ur.).
Zagreb : Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. 40-40 (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

31. Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Bojović, Viktor; Tossi, Alessandro.
Design optimisation of novel peptide antibiotics predicted to have high selectivity against G-negative bacteria // The 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja ; Smith, David (ur.).
Zagreb : Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. 59-59 (poster,sažetak,znanstveni).

32. Paško Županović; Domagoj Kuić; Milan Brumen; Aleš Fajmut; Davor Juretić.
Osmoza pri stalnom obujmu, negativan tlak. Podizanje vode u visokim stablima // Knjiga sažetaka 6. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva.
Zagreb, 2009. 141-141 (poster,sažetak,znanstveni).

33. Petrov, Dražen; Hlevnjak, Mario; Zagrovic, Bojan.
Effects of carbonylation on the stability of proteins // The 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja: Smith, David (ur.).
Zagreb : Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. 72-72 (poster,sažetak,znanstveni).

34. Wlodarski, Tomasz; Hlevnjak, Mario; Awile, Omar; Krisko, Anita; Sbalzarini, Ivo; Zagrovic, Bojan.
Studying protein‐protein interactions using computer simulations: from specific effects to protein ecology // The 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja: Smith, David (ur.).
Zagreb : Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. 23-23 (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

35. Zagrovic, Bojan.
Studying protein‐protein interactions using computer simulations: from specific effects to protein ecology // .
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

36. Zagrovic, Bojan.
Conformational selection and induced fit mechanism underlie specificity in noncovalent interactions with ubiquitin // .
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

37. Žagrović, Bojan.
Glimpses of biomolecular structure and dynamics through worldwide distributed computing: from protein folding to structure determination // .
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

38. Juretić, Davor.
Enzymes and living cells as functionally optimized systems for coupling thermodynamic to biological evolution // Entropy in Biomolecular Systems - MedILS Workshop, Split, Croatia, August 2008.
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni). URL link to work

39. Žagrović, Bojan.
Helical signature in the diffraction patterns of random walk chains // EMBO YIP meeting, EMBL, Heidelberg, Germany, June 2008.
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni). URL link to work

40. Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Bojović, Viktor; Lučić, Bono; Ilić, Nada.
Design principles for peptide antibiotics // From Solid State to Biophysics, 4-th conference, Cavtat, Croatia, June 2008.
(poster,sažetak,znanstveni).

41. Juretić, D.; Vukičević, D.; Bojović, V.; Ilić, N.; Lučić, B.
Design principles for peptide antibiotics and toxins // From Solid State to Biophysics, 4-th conference, Cavtat, Croatia, June 2008.
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).

42. Županović, Paško.
Bacterial chemotaxis and entropy production // From solid state to biophysics IV : Book of abstracts.
(predavanje,sažetak,znanstveni).

43. Žagrović, Bojan.
Computer simulations in the modern molecular biology research // EMBO meeting on cellular signaling and molecular medicine, Cavtat, Croatia, June 2008.
(pozvano predavanje,sažetak,znanstveni). URL link to work

44. Brumen, Milan; Županović, Paško; Jagodič, Marko: Juretić, Davor.
Bacterial chemotaxis and entropy production // Maximum Entropy Production in the Earth system, Jena, Germany, May 2008.
(predavanje,sažetak,znanstveni). URL link to work

45. Kuić, Domagoj; Županović, Paško.
Relaxation of lineary coupled oscillators // Maximum Entropy Production in the Earth system, Jena, Germany, 2008.
(poster,sažetak,znanstveni).

46. Juretić, Davor; Bonačić-Lošić Željana; Županović, Paško; Dewar, Roderick.
Optimization of enzymatic kinetics by using MaxENT and MEP entropy principles // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural Bioinformatics.
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak).

47. Juretić, Davor; Lučić, Bono; Bojović, Viktor; Ilić, Nada.
Designing peptide antibiotics with potential medical applications // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural Bioinformatics.
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

48. Županović, Paško; Brumen, Milan; Jagodić, Marko; Juretić, Davor.
Bacterial chemotaxis and entropy production // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural Bioinformatics.
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

49. Juretić, Davor; Bojović, Viktor; Lučić, Bono; Ilić, Nada.
Predicting the therapeutic index of peptide antibiotics // Third Austrian-Croatian Science Days, Grac, Austrija, listopad 2007.
(poster,sažetak,znanstveni).

50. Kuić, Domagoj; Županović, Paško.
Relaksacija mehaničkog sustava slabo vezanih oscilatora // Peti znanstveni sastanak HFD-a, Primošten, Hrvatska, listopad 2007.
(poster,sažetak,znanstveni).

51. Županović, Paško; Botrić, Srećko; Juretić, Davor.
Relaxation proceses and maximum entropy production principle // Peti znanstveni sastanak HFD-a : Knjiga sažetaka.
(poster,sažetak,znanstveni).

52. Juretić, Davor; Bojović, Viktor; Lučić, Bono.
Sequence attributes for estimating the therapeutic index of peptide antibiotics // The 2nd Opatija Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Darko Babić, Nađa Došlić, David Smith, Sanja Tomić, Kristian Vlahoviček (ur.).
Zagreb : Ruđer Bošković Institute, Zagreb, Croatia, 2007. 19-19 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).

53. Lučić, Bono; Batista, Jadranko; Juretić, Davor.
Poboljšanje modela za predviđanje kristalizacije proteina // Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva / A. Dulčić i dr. (ur.).
Zagreb : Fizički odsjek, PMF Zagreb, 2007. 106-106 (poster,sažetak,znanstveni).
Vrh
 
  Neobjavljena sudjelovanja na skupovima
 

1. Kuić, Domagoj.
Entropy production based on MaxEnt principle // Nonabelian Gauge Theories and Quark Matter, 6th AUSTRIAN-CROATIAN-HUNGARIAN MEETING, Summer Workshop for Theoretical Physics.
2013. (predavanje,međunarodna recenzija,ppt prezentacija,znanstveni). prilozen text radaURL link to work

2. Bojović, Viktor; Skala, Karolj; Juretić, Davor.
University of Split servers for membrane polypeptides // .
(pozvano predavanje,međunarodna recenzija,neobjavljeni rad,znanstveni).
Vrh
 
  Disertacije
 

1. Ilić, Nada.
Design and testing of Adepantins – functional artificial antibiotics / doktorska disertacija.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 12.07. 2013, 138 str. Voditelj: Juretić, Davor i Tossi, Alessandro.

2. Kuić, Domagoj.
Temeljna načela prediktivne statističke mehanike kao osnova za teoriju ireverzibilnosti / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet u Zagrebu, 24.05. 2013., 86 str. Voditelj: Županović, Paško.URL link to work
Vrh
 
  Magistarski radovi
 

1. Plavčić, Miro.
Wilberforceov oscilator / magistarski rad.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 20.05. 2009, 37 str. Voditelj: Županović, Paško.
Vrh
 
  Diplomski radovi
 

1. Čakarić, Tonći.
Sila podizanja na aerodinamičke profile / završni rad - preddiplomski studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 1.03. 2013, 25 str. Voditelj: Županović, Paško.

2. Ivica, Josip.
Algorithmic and knowledge-based modifications of cell-penetrating peptide leading to its improved physicochemical properties and antimicrobial activity / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 15.01. 2013, 57 str. Voditelj: Juretić, Davor i Tossi, Alessandro.

3. Miljak, Marija.
Dimeric Analogue of a Natural Antimicrobial Peptide with Improved Activity and Selectivity: A Study Connecting Bioinformatics, Biophysics and Biochemistry / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 15.01. 2013, 58 str. Voditelj: Juretić, Davor i Tossi, Alessandro.

4. Vučemilović-Alagić, Nataša.
Antimicrobial activity of modified cell penetrating peptide and modified natural antimicrobial peptide against opportunistic (multiresistant) pathogens in hospital environment / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 4.10. 2013, 50 str. Voditelj: Juretić, Davor.

5. Kozić, Mara.
ASIMETRIČNI ANTIMIKROBNI PEPTIDI I NJIHOVA MJERENA SVOJSTVA / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 7.12. 2012, 86 str. Voditelj: Juretić, Davor.

6. Kralj, Tomica.
Fizikalna i kemijska svojstva peptida i proteina koji vežu srebro / završni rad - preddiplomski studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 9.10. 2012, 7 str. Voditelj: Juretić, Davor.

7. Pleić, Kristina.
Teorija informacije i statistička fizika / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 17.07. 2012, 41 str. Voditelj: Županović, Paško.

8. Primorac, Daria.
Analiza inicijalnog testa iz termodinamike i kinetičke teorije materije / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 10.10. 2012, 34 str. Voditelj: Županović, Paško.

9. Žeko, Petra.
Klasična teorija aerodinamičnih profila / završni rad - preddiplomski studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 24.09. 2012, 31 str. Voditelj: Županović, Paško.

10. Čapeta, Elvina.
Primjena kinematičke klupe u nastavi fizike / diplomski rad.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 30.09. 2011, 36 str. Voditelj: Županović, Paško.

11. Paradžik, Ana.
Hodgkin–Huxleyjeve jednadžbe u svjetlu današnjih saznanja o strukturi voltažnih kanala / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 12.07.2011. 2011, 38 str. Voditelj: Juretić, Davor.

12. Pavlinović, Damir.
Ovisnost tlaka zasićenih para o temperaturi / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 17.10.2011. 2011, 24 str. Voditelj: Županović, Paško.

13. Vučemilović - Alagić, Nataša.
Metastabilna stanja kapljevine / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 17.10.2011. 2011, 23 str. Voditelj: Županović, Paško.

14. Borozan, Marija.
Usporedba fizikalnih svojstava signalnih peptida iz vodozemaca i sisavaca / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 26.10.2010. 2010., 70 str. Voditelj: Juretić, Davor.

15. Lovrić, Josip.
Stirlingov motor / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 11.10.2010. 2010, 29 str. Voditelj: Županović, Paško.

16. Novković, Mario.
Adepantins, a new class of designed antimicrobial peptides / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 7.10.2010. 2010., 99 str. Voditelj: Juretić, Davor.

17. Žic, Mario.
Osmoza / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 30.09.2010 2010, 27 str. Voditelj: Županović, Paško.

18. Perišin, Antonija.
ANALIZA USPJEHA STUDENTA IZ PREDMETA OPĆA FIZIKA IV U ŠK. GOD. 2007/08 / završni rad - preddiplomski studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 1.10. 2009, 17 str. Voditelj: Županović, Paško.

19. Petrov, Dražen.
STUDIJA PONAŠANJA NESAVIJENOG POLIPEPTIDNOG LANCA U MEMBRANI UZ POMOĆ RAČUNALSKIH METODA MOLEKULARNE MEHANIKE / diplomski rad.
Split : Prirodoslovno matematički fakultet, 27.01. 2009, 44 str. Voditelj: Juretić, Davor ; Sokolić, Franjo ; Žagrović, Bojan.

20. Sanader, Željka.
Fizikalna svojstva koja razlikuju peptide antibiotike od peptida toksina / završni rad - preddiplomski studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 22.10.2009. 2009., 24 str. Voditelj: Juretić, Davor.

21. Šeputić, Petar.
PRIJENOS VODE I MINERALA U BILJKAMA / završni rad - diplomski/integralni studij.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 11.09.2009. 2009, 52 str. Voditelj: Županović, Paško.

22. Kodić, Ljiljana.
PRIMJENA LAGRANGEOVOG FORMALIZMA NA TITRANJA TIJELAA / diplomski rad.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 16.01. 2008, 40 str. Voditelj: Županović, Paško.

23. Bojović, Viktor.
Prilagodba PDB datoteka relacijskom modelu radi lakše vizualizacije membranskih proteina / diplomski rad.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 24.09.2007 2007, 77 str. Voditelj: Rosić, Marko.

24. Stipanović, Goran.
TERMOELEKTRIČKI EFEKT I ONSAGEROVE RELACIJE RECIPROČNOSTI / diplomski rad.
Split : Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, 19.09.2007. 2007, 28 str. Voditelj: Županović, Paško.
Vrh
 
upomoc
foot_4