hrvatski

Predviđanje pozicije eksona u DNK metodama digitalne obrade signala

Molekule DNK pohranjuju digitalnu informaciju koja predstavlja jedinstveni genetski otisak svakog živog organizma. Jedna od važnih uloga DNK je sinteza bjelančevina (proteina), u kojoj sudjeluju njezini dijelovi eksoni. U procesu sinteze, trojka (eng. triplet) nukleotida iz DNK određuje aminokiselinu, koja je građevni element bjelančevine. Četiri baze (A, T, C ili G) na tri pozicije daju 64 moguće kombinacije i nazivaju se kodon. Kako postoji svega 20 različitih aminokiselina, više kodona rezultiraju istom aminokiselinom. DNK lanac, kao i sam protein se na razne načine mogu predstaviti digitalnim signalima, realnim ili kompleksnim. Svojstva tih signala, pa čak i proces sinteze proteina, mogu se modelirati metodama digitalne obrade signala. Eksoni, aktivni dijelovi DNK u sintezi proteina, pokazuju svojstvo periodičnosti s periodom 3. To svojstvo, uz neka druga, može se iskoristiti za detekciju njihove pozicije. Analizirani su i uspoređeni različiti algoritmi za obradu signala, u vremenskoj ili spektralnoj domeni, s ciljem predviđanja pozicije eksona u DNK lancu. Korištene su javno dostupne baze DNK i proteina.

pozicija ekson; DNK metode; digitalna obrada signala

nije evidentirano