Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Pronalaženje struktura repeticija višeg reda u genomu insekta Tribolium castaneum koristeći metodu Global Repeat Map (CROSBI ID 601554)

Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa

Ines Vlahović, Matko Glunčić, Marija Rosandić, Vladimir Paar Pronalaženje struktura repeticija višeg reda u genomu insekta Tribolium castaneum koristeći metodu Global Repeat Map // Knjiga sažetaka, 8. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva. 2013. str. 127-127

Podaci o odgovornosti

Ines Vlahović, Matko Glunčić, Marija Rosandić, Vladimir Paar

hrvatski

Pronalaženje struktura repeticija višeg reda u genomu insekta Tribolium castaneum koristeći metodu Global Repeat Map

U prijašnjim istraživanjima genoma insekta Tribolium castaneum pokazalo se da veliki njegov dio se sastoji od ponavljajućih elemenata [1, 2] , 42%, što je blizu broja tandemnih repeticija primjećenih u genomu čovjeka. 17% tandemnih repeticija su TCAST sateliti. Koristeći našu Global Repeat Map metodu[3] (www.hazu.hr/grm/software/win/grm2012.exe), pokazali smo da postoje pravilne kao i složene repeticije višeg reda (HORovi) u genomu T. castaneum. U našem istraživanju zaključili smo da uzorak HORova u T.castaneum satelitima, TCAST, nisu prije identificirani pomoću standardnih metoda zbog varijacije u duljinama monomera od oko 20% (kod čovjeka su te varijacije oko 2%). Naši rezultati pokazuju da konstruirani HORovi zadovoljavaju osnovne kriterije definicija i da pomoću naše metode GRM možemo identificirati pravilne kao i složene repeticije višeg reda. Primjer T. castaneum pokazuje da bi bilo zanimljivo pretražiti repeticije višeg reda i u drugim insektima, ali i ljudski genom za identificiranje repeticija višeg reda koji imaju značajnu razliku u duljinama monomera.

tandemne repeticije; strukture višeg reda; sateliti; Global Repeat Map

nije evidentirano

engleski

Finding higer order repetition structures in insect genome Tribolium castaneum using Global Repeat Map method

nije evidentirano

tandem repetitions; higer order structures; satellites; Global Repeat Map

nije evidentirano

Podaci o prilogu

127-127.

2013.

nije evidentirano

objavljeno

Podaci o matičnoj publikaciji

Knjiga sažetaka, 8. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva

Podaci o skupu

8. Znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva

poster

06.08.2013-06.08.2013

Primošten, Hrvatska

Povezanost rada

Fizika