hrvatski

Klasifikacija kodirajućih regija u genomu

Danas korištene metode za detekciju mjesta izrezivanja introna su vrlo uspješne na jednostavnijim orgnizmima, dok im je uspješnost znatno lošija na složenijima. U ovom radu pokušala su se iskoristiti znanja iz vektorske kvantizacije za određivanje broja načina točnih mjesta izrezivanja. Dobiveni klasifikatori korišteni su za treniranje i testiranje statističkog paketa slučajne šume. Izlazne vrijednosti prikazane su Precision-Recall krivuljom te grafom važnosti. Iz krivulja dobivenih na temelju glasova klasifikatora i ulaznih podataka teško je zaključiti koja je bolja. Zaključak je da ovim načinom podjele ulaznih podataka nismo značajnije doprinijeli poboljšanju krivulje odnosno detektora za otkrivanje točnih mjesta izrezivanja. Također na temelju ovog rada nije moguće donijeti odluku o broju stvarnih načina točnih mjesta izrezivanja.

gen; genom; ekson; intron; detektor; nukleotid; kodirajući; nekodirajući; mjesto izrezivanja; podjela u grupe; unakrsna validacija

nije evidentirano