hrvatski

Predikcija kodirajućih regija korištenjem slučajnih šuma

Uspješno predviđanje mjesta izrezivanja kodirajućih regija od velike je važnosti za niz primjena. Poznato je da DNK pokazuje periodičnost i ponavljanje uzoraka – primjer je činjenica da se proteini generiraju iz kodona – skevence koju čine 3 nukleotida. U ovom radu korištena je metoda strojnog učenja, Random Forest, za detekciju i značajki koje su ključne u mehanizmu izrezivanja eksona i formiranja kodirajućih sekvenci, te uočavanje eventualnih pravilnosti i uzoraka koji se mogu pojaviti. Istraživanje je pokazalo da se te značajke nalaze uglavnom oko donorskog i akceptorskog mjesta, i iako ih nije mnogo, uzimajući samo njih u obzir, može se izgraditi šuma koja vrlo uspješno klasificira stvarne donore i akceptore.

genom; ekson; intron; donor; akceptor; kodirajući; nekodirajući; mjesto izrezivanja; Random Forest; klasifikacija

nije evidentirano