hrvatski

Molekularna diferencijacija sojeva Lactobacillus plantarum iz hrvatskih autohtonih fermentiranih proizvoda temeljena na numeričkoj analizi makrorestrikcijskih i proteinskih profila

Proučavanje bioraznolikosti kao i diferencijacija na razini soja su važne za razumijevanje molekularne evolucije kao i za selekciju sojeva s industrijski značajnim svojstvima te općenito predstavljaju priliku za napredak u biotehnologiji. Cilj ovoga rada bila je diferencijacija osam autohtonih sojeva Lactobacillus plantarum pomoću dvije različite molekularne metode kako bi utvrdili u kojoj se mjeri razlikuju sojevi iste vrste koji potječu iz različitih okolišnih niša. Denaturirajuća poliakrilamidna gel elektroforeza ukupnih staničnih proteina (WCP/SDS-PAGE) i analiza restrikcijskih fragmenata DNA elektroforezom u pulsirajućem polju (PFGE) su korištene za diferencijaciju sojeva i procjenu fenotipske i genotipske raznolikosti i varijabilnosti. Proteinski i makrorestrikcijski profili dobiveni svakom od navedenih metoda prevedeni su u dvodimenzionalnu binarnu matricu te su nakon numeričke analize podataka primjenom računalnog programa Phoretix 1D dobiveni dendrogrami koji pokazuju filogenetski odnos i relativnu sličnost između ispitivanih sojeva. Također je ispitana osjetljivost ovih sojeva na različite antibiotike. Svi sojevi su rezistentni na nalidiksinsku kiselinu, te u većoj ili manjoj mjeri osjetljivi na tetraciklin, ampicilin, streptomicin i kloramfenikol. Rezultati su jasno ukazali na postojanje značajne raznolikosti autohtonih sojeva L. plantarum koja je vidljiva kroz njihove molekularne karakteristike kao genomski i proteinski polimorfizam.

Lactobacillus plantarum; molekularna diferencijacija; WCP/SDS-PAGE; PFGE; klasterska analiza

nije evidentirano