Utjecaj mutacija C1400U, C1402U i C1409U u 16S rRNA na bakterijski rast i rezistenciju na aminoglikozidne antibiotike posredovanu metil-transferazom RmtC (CROSBI ID 366571)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Živaljić, Iva
Maravić Vlahoviček, Gordana
hrvatski
Utjecaj mutacija C1400U, C1402U i C1409U u 16S rRNA na bakterijski rast i rezistenciju na aminoglikozidne antibiotike posredovanu metil-transferazom RmtC
Nedavnom pojavom patogenih sojeva bakterija koje su razvile novi mehanizam otpornosti, rezistencija bakterija na aminoglikozidne antibiotike postaje sve veći problem u liječenju infekcija. Mehanizam otpornosti na aminoglikozide modifikacijom ciljnog mjesta djelovanja posredovan 16S rRNA metil-transferazama iz porodica Arm i Kam uobičajen je kod bakterija koji su prirodni proizvođači antibiotika. Mehanizam rezistencije pronađen kod patogenih bakterija posredovan je novim metil-transferazama iz porodice Arm, nađenim isključivo u novim patogenim sojevima. Cilj je rada odrediti kako mutacije evolucijski očuvanog ribosomskog mjesta A unutar 16S rRNA utječu na bakterijski rast i rezistenciju na aminoglikozidne antibiotike u bakterijskim stanicama koje su prirodno osjetljive na aminoglikozide i u onima koje su rezistentne jer proizvode metil-transferazu RmtC. PCR-mutagenezom načinjene su mutacije C1400U, C1402U i C1409U te je određivanjem generacijskog vremena bakterija i minimalne inhibitorne koncentracije kanamicina ispitan utjecaj mutacija na vezanje aminoglikozida u mjesto A te na interakciju metil-transferaze RmtC s ribosomom. Rezultati pokazuju da mutacija C1409U smanjuje osjetljivost bakterije na kanamicin, što upućuje da su navedeni nukleotidi dio veznog mjesta kanamicina na bakterijskom ribosomu. Mutacija C1402U povećava osjetljivost na kanamicin i usporava bakterijski rast, što upućuje da je taj dio ribosoma ključan za njegovu funkciju. Unosom gena za metil-transferazu RmtC u bakteriju s mutacijom C1400U nije došlo do pojave rezistencije kao kod bakterija s ostalim ispitanim mutacijama, što znači da citozin na položaju 1400 u 16S rRNA stupa u interakciju s enzimom i dio je veznog mjesta enzima na ribosomu. Rad daje uvid u ulogu evolucijski očuvanog mjesta A u 30S podjedinici bakterijskog ribosoma, a dobiveni rezultati temelj su za daljnja istraživanja o mehanizmu djelovanja metil-transferaza iz porodice Arm u rezistenciji patogenih sojeva na aminoglikozidne antibiotike. Definiranjem svih potencijalnih veznih mjesta enzima i interakcija s enzimom, mogli bi se razviti lijekovi inhibitori tog procesa i suzbiti rezistencija patogenih sojeva.
aminoglikozidni antibiotici; rezistencija; metil-transferaza RmtC; ciljana mutageneza; bakterijski ribosom; 16S rRNA
nije evidentirano
engleski
Effects of mutations C1400U, C1402U AND C1409U in 16S rRNA on bacterial cell growth and methyltransferase RmtC-mediated aminoglycoside resistance
nije evidentirano
aminoglycoside antibiotics; resistance; RmtC methyltransferase; targeted mutagenesis; bacterial ribosome; 16S rRNA
nije evidentirano
Podaci o izdanju
95
07.07.2011.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Farmaceutsko-biokemijski fakultet
Zagreb