Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Utjecaj mutacija u ribosomskom mjestu A na aktivnost metil-transferaza Sgm i RmtB (CROSBI ID 395914)

Ocjenski rad | diplomski rad

Franić, Maja Utjecaj mutacija u ribosomskom mjestu A na aktivnost metil-transferaza Sgm i RmtB / Maravić Vlahoviček, Gordana (mentor); Zagreb, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, . 2015

Podaci o odgovornosti

Franić, Maja

Maravić Vlahoviček, Gordana

hrvatski

Utjecaj mutacija u ribosomskom mjestu A na aktivnost metil-transferaza Sgm i RmtB

Aminoglikozidi se koriste u liječenju raznih infekcija uzrokovanih najčešće gram-negativnim aerobnim bakterijama. No, u današnje vrijeme javlja se problem sve češće pojave rezistencije na antibiotike. Jedan od mehanizama rezistencije na aminoglikozide je modifikacija veznog mjesta djelovanjem specifičnih metil-transferaza – enzima koji su se najprije razvili kod bakterija vrsta Streptomices i Micromonospora koje su prirodni prizvođači aminoglikozidnih antibiotika. Zadnje desetljeće dolazi do sve češće pojave srodnih metil-transferaza i kod patogenih sojeva. Mehanizam djelovanja metil-transferaza je metilacija A-mjesta u ribosomskoj podjedinici 30S, mjesta vezanja aminoglikozidnih antibiotika. Dva su poznata mjesta djelovanja ovih enzima: metilacija G1405 na položaju N7 i A1408 na položaju N1. Metil-transferaze proučavane u ovom diplomskom radu su Sgm iz bakterije Micromonospora zionensis, prirodnog proizvođača antibiotika i RmtB iz patogena Serratia marcescens. Oba enzima modificiraju N7 položaj G1405 i ostvaruju rezistenciju bakterija na 4, 6-2-deoksistreptaminske aminoglikozidne antibiotike. Cilj rada bio je proučiti utjecaj mutacija u A-mjestu 16S rRNA na aktivnost metil-transferaza i njihovu sposobnost metilacije G1405 te na taj način dobiti uvid u prirodu vezanja enzima na ciljno mjesto djelovanja. U laboratoriju su uzgojeni sojevi bakterijeEscherichia coli MC338 sa 16S rRNA divljeg tipa ili s pojedinačnim mutacijama U1406A, A1408G, G1491C ili U1495A. Sojevi su eksprimirali enzime Sgm ili RmtB. Nakon izolacije rRNA iz E. coli provedena je reakcija produljenja početnice reverznom transkriptazom na uzorcima prethodno tretiranim anilinom i natrijevim borhidridom za detekciju modifikacije m7G1405. Dobiveni produkti analizirani su elektroforezom u 9% denaturirajućem poliakrilamidnom gelu.Rezultati upućuju na to da bi za vezanje enzima metil-transferaze Sgm mogao biti važan nukleotid A1408, dok se za RmtB pokazao važniji nukleotid U1406. Rezultati upućuju i na činjenicu da bi Sgm izoliran iz proizvođača antibiotika, bakterije M. zionensis i RmtB iz patogenog soja S. marcescens mogli imati različito mjesto vezanja na molekuli 16S rRNA i s njom stupati u različite interakcije. Ovaj rad daje doprinos u proučavanju rezistencije na aminoglikozidne antibiotike putem ribosomskih metil-transferaza, kao i proučavanju bakterijske 16S rRNA i evolucijski očuvanog dekodirajućeg mjesta na ribosomu. Uvid u interakcije između metiltransferaza Sgm i RmtB i podjedinice 30S daju temelj za nastavak istraživanja koja će omogućiti razvoj specifičnog inhibitora ovih enzima i suzbiti bakterijsku rezistenciju na aminoglikozidne antibiotike.

Aminoglikozidni antibiotici; 16S rRNA; bakterijski ribosom; G1405; m7G; metil-transferaza Sgm; metil-transferaza RmtB

nije evidentirano

engleski

The effects of mutations on ribosomal A site on Sgm and RmtB methyltransferase activity

nije evidentirano

Aminoglycoside antibiotics; 16S rRNA; bacterial ribosome; G1405; m7G; Sgm methyltransferase; RmtB methyltransferase

nije evidentirano

Podaci o izdanju

63

29.04.2015.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Farmaceutsko-biokemijski fakultet

Zagreb

Povezanost rada

Farmacija, Biologija