Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Gornja granica u sastavljanju genoma (CROSBI ID 427496)

Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad

Požega, Luka Gornja granica u sastavljanju genoma / Šikić, Mile (mentor); Vaser, Robert (neposredni voditelj). Zagreb, Fakultet elektrotehnike i računarstva, . 2019

Podaci o odgovornosti

Požega, Luka

Šikić, Mile

Vaser, Robert

hrvatski

Gornja granica u sastavljanju genoma

U ovom radu je opisan alat za raˇcunanje gornje granice u sastavljanju genoma. U potpunosti je napisan u jeziku C++ i testiran na nekoliko skupova podataka. Alat ispisuje postotak pokrivenosti genoma ovisno o ulaznim podacima dobivenih sekvenciranjem. Takod¯er se kreira i datoteka u GFA format koja služi za sastavljanje grafa. U radu je korišteno nekoliko algoritama poput sweep line algoritma, pretraživanja u dubinu i Needleman–Wunsch algoritma. Testiran je na dva skupa podataka: genomu bakterije Escherichie coli i kvascu Saccharomyces cerevisiae. Glavnu primjenu ´ce na´ci u evaluiranju kvalitete podatak dobivenih sekvenciranjem, kao i kod evaluiranja drugih alata za sastavljanje genoma.

gornja granica, sastavljanje genoma, graf

nije evidentirano

engleski

Upper bound in genome assembly

nije evidentirano

upper bound, genome assembly, graph

nije evidentirano

Podaci o izdanju

22

03.07.2019.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zagreb

Povezanost rada

Računarstvo