Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Mapiranje dugačkih očitanja (CROSBI ID 428085)

Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad

Pongračić, Kristijan Mapiranje dugačkih očitanja / Šikić, Mile (mentor); Vaser, Robert (neposredni voditelj). Zagreb, Fakultet elektrotehnike i računarstva, . 2019

Podaci o odgovornosti

Pongračić, Kristijan

Šikić, Mile

Vaser, Robert

hrvatski

Mapiranje dugačkih očitanja

Mapiranje dugačkih očitanja jest problem pronalaska dijela reference na koje bi se konkretno očitanje moglo najbolje poravnati. U ovom radu opisana je implementacija programa koji mapira dugačka očitanja. Program je napisan u programskom jeziku C++. Koristi se pristup u kojem se ne gleda cijelo očitanje, već samo krajevi duljine K. Referenca se podijeli na regije duljine 2K s preklapanjem od K te se indeksira. Indeksiranjem krajeva očitanja te usporedbom s indeksima na referenci mogu se brzo filtrirati kandidatne pozicije. Rezultati su uspoređeni s Minimap2 metodom. Izvorni kôd dostupan je na https://github.com/lbcb-edu/BSc- thesis-18- 19/tree/kpongracic.

bioinformatika, mapiranje, dugačka očitanja, Minimap2

nije evidentirano

engleski

Long Reads Mapping

nije evidentirano

bioinformatics, mapping, long reads, Minimap2

nije evidentirano

Podaci o izdanju

38

03.07.2019.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zagreb

Povezanost rada

Računarstvo