hrvatski

Biokemijska i molekularna analiza izolata bakterije Escherichia coli izdvojenih iz hrane životinjskog podrijetla i obrisaka klaoničkih trupova

Hrana životinjskog podrijetla predstavlja mogući izvor patogenih sojeva Escherichia coli opasnih za ljude. Iako su većina sojeva crijevni komenzali, pojedini mogu uzrokovati crijevne (intestinalne) i izvancijevne (ekstraintestinalne) infekcije. Njihova patogenost povezana je s prisutnošću gena za čimbenike virulencije, pripadnošću filogrupi te s biokemijskim svojstvima kod pojedinih serovarova. U ovom istraživanju pretraženo je 100 izolata bakterije E. coli izdvojenih iz uzoraka mesa i obrisaka trupova različitih vrsta životinja. Izolatima su određene biokemijske karakteristike VITEK2 sustavom, a molekularnim metodama određena je prisutnost gena za čimbenike virulencije i pripadnost filogrupi. U izolatima je dokazana prisutnost patogrupa: EAEC (EAST11), ETEC (STII), EPEC (eae), ExPEC (cnf1, cnf2) i EHEC/VTEC (vtx1, vtx2). Najprevalentnija patogrupa je EAEC (20%), dokazana u izolatima različitog podrijetla. Patogrupe EPEC (9%) i ExPEC (6%) također su dokazane u izolatima različitog podrijetla, dok su patogrupe ETEC (5%) i VTEC (2%) dokazane u izolatima podrijetlom od divljači i svinja. Najviše gena za čimbenike virulencije ustanovljeno je u izolatima podrijetlom od divljači. Biokemijskom karakterizacijom izolata ustanovljena je povezanost između prisustva eae gena i aktivnosti alkalinizacije sukcinata. Osim toga, također je primjetna povezanost između prisustva cnf1 gena i aktivnosti enzima arilamidaze prema tirozinu. Pomoću lančane reakcije polimerazom (engl. polymerase chain reaction – PCR) izolati su svrstani u filogrupe. Najprevalentije filogrupe bile su A (38%) i B1 (36%) u koje je svrstana većina pretraživanih izolata. Od ostalih filogrupa, s manjom učestalošću, bile su zastupljene filogrupe B2 (4%), C (3%), D (9%), E (4%) i F (6%). Rezultati statističke analize prikazuju povezanost između podrijela izolata i pripadnosti filogrupi te također prikazuju nova saznanja o filogenetskoj strukturi E. coli u domaćih životinja na području Republike Hrvatske. Prikazani rezultati ukazuju kako hrana različitog životinjskog podrijetla predstavlja izvor crijevnih i izvancrijevnih patogenih E. coli.

Escherichia coli, geni za čimbenike virulencije, filogrupa, biokemijske karakteristike

nije evidentirano