engleski

Distribution of thy polymorphic markers in the CFTR gene

Cistična fibroza (CF) je autosomno recesivna bolest koja nastaje kao posljedica mutacije u samo jednom genu, genu CFTR (od engl. cystic fibrosis transmembrane conductance regulator gene). Produkt gena je protein CFTR koji djeluje kao prenosilac iona klora kroz membrane epitelnih stanica. Unutar gena CFTR do danas je opisano preko 1000 mutacija, od kojih su mnoge vrlo rijetke, a njihova raznolikost i različita zastupljenost unutar jedne populacije u mnogome otežavaju dijagnostiku cistične fibroze. Najučestalija mutacija je delecija tri para baza u desetom eksonu, delta F508, s prosječnom učestalošću od 67%. U genu CFTR opisan je i velik broj polimorfizama (preko 200) koje se primjenjuju u standardoj dijagnostici, pogotovo unutar obitelji s nepoznatom mutacijom. Do danas je objavljeno niz studija koje govore o važnosti primjene polimorfnih biljega u dijagnosticiranju i praćenju nasljeđivanja cistične fibroze. Cilj ove studije bio je odrediti raspodjelu tri polimorfna, intragenska biljega, IVS 8 CA, IVS 1 CA i IVS 17b CA, unutar zdravih ispitanika i ispitanika koji imaju kliničku sliku cistične fibroze. Kod oboljelih osoba pratili smo i pojavnost 15 najučestalijih mutacija (DF508, DI507, G542X, G551D, R553X, N1303k, 621+1G--T, W1281X, 3849+10kbC--T, 1717-1G--A, 2789+5G--A, 3849+4A--G, R1162X, 1898+1G--A i R117H). Usporedbom rezultata obje analize odredili smo povezanost pojedine mutacije i pripadajućeg haplotipa. Poznato je, naime, da su i pojedine mutacije značajno češće povezane s pojedinim polimorfnim biljezima. Za umnažanje ponavljajućih sljedova nukleotida koristili smo metodu lančane reakcije polimerazom, PCR, upotrebom ranije objavljenih početnica. Točan broj ponavljajućih sljedova odredili smo elektroforezom u gelu poliakrilamida. U cilju određivanja raspodjele pojedinih haplotipova unutar zdravih i bolesnih ispitanika proveli smo statističku analizu te odredili postoji li povezanost pojedine mutacije sa specifičnim haplotipom. Za određivanje 15 najučestalijih mutacija također smo koristili metodu lančane reakcije polimerazom, uz upotrebu ranije objavljenih početnica, a analizu dobivenih odsječaka provodili smo metodom RFLP, te analizom heterodupleksa. Rezultati ove studije pokazali su, dosad nepoznatu, raspodjelu polimorfnih biljega unutar gena CFTR u stanovnika Hrvatske. Služit će kao smjernica u dijagnosticiranju cistične fibroze metodama molekularne dijagnostike, naročituo unutar obitelji koje su opterećene cističnom fibrozom, a gdje nisu pronađene mutacije gena.

cystic fibrosis; CFTR gene; polymorphism

nije evidentirano