hrvatski

Interakcije konjugata interkalator - nukleobaza s nukleotidima i nukleinskim kiselinama u vodenom mediju

Interakcije konjugata fenantridinij-nukleobaza s jednolančanim i dvolančanim polinukleotidima u vodenim otopinama ispitane su fluorimetrijskim i UV/Vis titracijama te određivanjem točke mekšanja. Konjugat fenantridina s kovalentno vezanim adeninom veže se na poliU (U = uracil) velikim afinitetom (log Ks = 4 - 5) uz specifične spektroskopske promjene u usporedbi s uracilnim konjugatom i referentnim spojem bez kovalentno vezane nukleobaze (log Ks = < 3). Specifično vezanje adeninskog konjugata na poliU upućuje na moguće vodikove veze između adeninskog konjugata s uracilima polinukleotida. Konstante stabilnosti kompleksa metiliranih (N5) fenantridinijevih konjugata s jednom kovalentno vezanom nukleobazom ovise o pH otopine: log Ks = 2 - 3 (pH = 7) i log Ks < 3 (pH = 5) za poliU, te log Ks = 4 - 5 (pH = 5 and 7) za poliA (A = adenin). Određivanjem točke mekšanja uočena je značajna stabilizacija dvostruke uzvojnice poliAH+-poliAH+ po vezanju adeninskog konjugata fenantridina. Konjugati fenantridina s dvije kovalentno vezane nukleobaze daju komplekse stehiometrije 1:1 u vodenim otopinama (pH = 5) s nukleotidima (log Ks = 1 - 2), te komplekse s polinukleotidima: log Ks = 5 - 6 za dvostruke uzvojnice (poliAH+-poliAH+, ctDNA, poliA-poliU) i log Ks = 3 - 4 za poli U. Pri vezanju uracilnog konjugata fenantridina uočeno je bolje vezanje na komplementarnu dvostruku uzvojnicu poliA u usporedbi s adeninskim konjugatom i referentnim spojem.

: konjugati fenantridinij-nukleobaza ; interkalatori ; nukleotidi ; polinukleotidi ; DNA ; RNA ; selektivnost vezanja ; fluorimetrijska i UV/Vis spektroskopija ; točka mekšanja

nije evidentirano