Genetička varijabilnost virusa tristeza u Hrvatskoj (CROSBI ID 347895)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Ruščić, Jelena
Škorić, Dijana
hrvatski
Genetička varijabilnost virusa tristeza u Hrvatskoj
Virus tristeza (Citrus tristeza virus, CTV) je ekonomski najznačajniji virusni patogen agruma. Hrvatski agrumi su uglavnom cijepljeni na podlogu Poncirus trifoliata koja je tolerantna na virus tristeza te uglavnom ne pokazuju simptome infekcije. Preliminarna istraživanja virusa tristeza u Hrvatskoj potvrdila su prisutnost izrazito patogenih sojeva za koje se prethodno vjerovalo da nisu prisutni na Mediteranu. Kako je nedavno na Mediteranu zabilježena prisutnost smeđe uši agruma (Toxoptera citricida), najefikasnijeg CTV-vektora, problem rasprostranjivanja virusa tristeza ponovno je aktualan u Europi. Metodom RT-PCR potvrđena je prisutnost virusa unutar analiziranih uzoraka agruma s područja Hrvatske, dok je metodom SSCP dokazano postojanje više varijanti nukleotidnog slijeda gena za kapsidni protein (CP-gena) unutar svakog pojedinog CTV-izolata. Filogenetskom analizom sekvenci CP-gena potvrđeno je da se analizirane sekvence grupiraju u filogenetsku skupinu 2 zajedno s referentnim sekvencama izolata koji izazivaju blage simptome, te u filogenetske skupine 3a, 4 i 5 zajedno s referentnim sekvencama izolata koji izazivaju izuzetno jake simptome. Ovi rezultati ukazuju na visoku varijabilnost izolata virusa tristeza u Hrvatskoj te na njihov visoki patogeni potencijal, bez obzira na nepostojanje vidljivih simptoma infekcije.
CTV; gen za kapsidni protein(CP); RT-PCR; SSCP; filogenetska analiza
voditelj eksperimentalnog dijela rada bila je dipl.ing.Silvija Černi
engleski
Genetic variability of Citrus tristeza virus in Croatia
nije evidentirano
CTV; coat protein gene (CP); RT-PCR; SSCP; phylogenetic analysis
nije evidentirano
Podaci o izdanju
49
21.12.2007.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb