Metoda molekulske zamjene za određivanje strukture ljudske dioksigenaze 3-hidriksiantranilne kiseline (CROSBI ID 347907)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Sambolec, Marija
Prugovečki, Biserka ; Matković-Čalogović, Dubravka
Karlić, Rosa
hrvatski
Metoda molekulske zamjene za određivanje strukture ljudske dioksigenaze 3-hidriksiantranilne kiseline
Ljudska dioksigenaza 3-hidroksiantranilne kiseline (3HAO_human) je monomerni citosolični protein koji se sastoji od 286 aminokiselinskih ostataka, relativne molekulske mase 32542 Da. Katalizira sintezu kinolinske kiseline (QUIN) iz 3-hidroksiantranilne kiseline u kinureninskom putu kod metabolizma triptofana. Visoki udio 3HAO_human se nalazi u perifernim organima kao što su jetra i bubrezi, a u malim iznosima je također prisutan i u centralnom živčanom sustavu. Sljed proteina 3HAO_human je sravnjen sa sljedovima pronađenih homologa. Trodimenzionalna struktura proteina 3HAO_human (prostorna grupa P1) određena je metodom molekulske zamjene pri rezoluciji 2, 43 Å ; ; ; ; . Za to su korištene dobivene modelne molekule i riješena struktura ljudske dioksigenaze 3-hidroksiantranilne kiseline u prostornoj grupi P212121 (2qnk), te koordinate nativnog proteina, proteina u kompleksu sa platinom i proteina u kompleksu sa paladijem i platinom. Dobiveni modeli strukture proteina su analizirani, a model cijele strukture dobiven prema riješenoj strukturi 2qnk utočnjen je do R-faktora 19, 3% (Rfree 35, 4%).
dioksigenaza 3-hidroksiantranilne kiseline; homologija; sravnjenje sljedova; proteinska kristalografija; struktura proteina
nije evidentirano
engleski
The Molecular Replacement Method in Structure Determination of the Human 3-Hydroxyanthranilic Acid Ddiokygenase
nije evidentirano
3-hydroxyanthranilic acid dioxygenase; homology; sequence alignments; protein crystallography; protein structure
nije evidentirano
Podaci o izdanju
60
14.12.2007.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb