engleski

Simultaneous detection of grapevine phytoplasmas from ribosomal groups 16SrV and 16SrXII-A by triplex real-time PCR assay

Uzročnici žutica vinove loze su fitoplazme (genus 'Candidatus Phytoplasma') – patogene bakterije bez stanične stijenke koje u prirodi naseljavaju floem biljaka i kukce parazitirajući tako u domaćinima iz dva carstva. Genom fitoplazmi vrlo je reduciran i nedostaju mu geni za osnovne metaboličke puteve, što onemogućava kultiviranje ovih bakterija na umjetnim hranidbenim podlogama. Najznačanije i najrasprostranjenije fitoplazme vinove loze u Europi pripadaju ribosomskim skupinama 16SrV (Flavescence Dorée ; FD) i 16SrXII-A (Bois Noir ; BN). Istraživanja žutica vinove loze u Hrvatskoj se sustavno provode od 1997., a do sada je potvrđena prisutnost fitoplazmi BN te Aster Yellows (16SrI). Lokacije iz istočne Slavonije, Međimurja i Istre procijenjene su kao najteže pogođene ovim zarazama te s najvećom potencijalnom mogućnošću zaraze fitoplazmom FD. Osjetljiva metoda triplex real-time PCR koja omogućava istovremenu detekciju gena map fitoplazmi BN i FD te kloroplastne DNA loze kao endogene kontrole pomoću TaqMan&reg ; MGB proba, primijenjena je za testiranje uzoraka loze, korova i kukaca. PCR-RFLP-analiza fitoplazmatskog gena za 16S rRNA provedena je paralelno. U 27 od 49 uzoraka loze te nekoliko uzoraka korova i kukaca identificirane su samo fitoplazme BN. Prisutnost fitoplazmi FD dokazana je samo u 2 uzorka biljke Clematis vitalba L. Metoda triplex real-time PCR pokazala se osjetljivom i pogodnom za sustavna i istovremena praćenja ovih patogena.

bacteria; map gene; phytoplasmas; real-time PCR; TaqMan MBG probe

nije evidentirano