Genska varijabilnost hipovirusa na području Hrvatske (CROSBI ID 356011)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Krstin, Ljiljana
Ćurković Perica, Mirna
hrvatski
Genska varijabilnost hipovirusa na području Hrvatske
Gljiva Cryphonectria parasitica uzročnik je raka kore pitomog kestena. Cryphonectria hipovirus 1 (CHV-1) zaražava gljivu i utječe na prirodnu biološku kontrolu bolesti. Ukupno 338 izolata gljive C. parasitica prikupljeno je iz 10 hrvatskih populacija kestena. Hipovirulentni izolati gljive prisutni su u svim istraživanim populacijama s učestalošću od 12, 7% u primorskom do 66, 6% u kontinentalnom dijelu Hrvatske. Prisutnost hipovirusa u izolatima gljive potvrđena je izolacijom dsRNA. Virusni izolati okarakterizirani su RT-PCR/RFLP metodom te sekvenciranjem hipovirusnog ORF-A. Utjecaj istraženih virusnih izolata na gljivu određen je proučavanjem njezinog rasta i sporulacije u in vitro uvjetima. Svi hrvatski izolati pripadaju CHV-1 virusu talijanskog podtipa te su slični ili identični izolatima drugih europskih zemalja. Tri izolata prikupljena prije 24 godine imala su slične ili identične restrikcijske obrasce što ukazuje na sporu evoluciju hipovirusa. U uvjetima in vitro, rast i sporulacija većine hipovirulentnih izolata gljive nije se razlikovala od virulentnih izolata gljive pa će biti potrebna dodatna istraživanja kako bi se odabrali odgovarajući CHV-1 izolati pogodni za biološku kontrolu. U populacijama Požega i Šamarica utvrđeno je 10 vc tipova. Dominantni vc tip bio je EU-2 (44, 8%), dok je drugi po zastupljenosti bio vc tip EU-1 (21, 8%). Vc tip EU-12 bio je treći po zastupljenosti (18, 3%) i pronađen je samo u Požegi. S obzirom na najčešće vc tipove, istraživane populacije imaju obilježja i sjeverozapadnih i jugoistočnih europskih populacija. Prisutnost peritecija i dvaju MAT tipova u približno jednakim omjerima ukazuje na spolno razmnožavanje gljive C. parasitica.
Cryphonectria parasitica; dsRNA/RT-PCR/RFLP; hipovirulentnost; rak kore pitomog kestena
nije evidentirano
engleski
Genetic variability of the hypovirus in Croatia
nije evidentirano
Cryphonectria parasitica; chestnut blight; dsRNA/RT-PCR/RFLP; hypovirulence
nije evidentirano
Podaci o izdanju
140
22.09.2009.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb