engleski

Molecular cloning of the DNA differences between Q. robur and Q. suber in the study of the genome evolution in Quercus genus

Hrast lužnjak (Q. robur) i hrast plutnjak (Q. suber), dvije filogenetski udaljene vrste, određuje vrlo slična veličina genoma, gotovo identični kariotipovi, te kromosomska organizacija heterokromatina i ribosomskih gena. Isto vrijedi za jedanaest vrsta hrastova različitih filogenetskih položaja i geografske rasprostranjenosti. U svrhu istraživanja diferencijacije genoma na molekularnoj razini primijenjena je tehnika Representational Difference Analysis. Tehnika se bazira na substrakciji identičnih dijelova dvaju genoma (Q. suber i Q. robur) što omogućuje izolaciju specifičnih DNA slijedova za samo jednu vrstu (Q. robur). Specifični DNA slijedovi za vrstu Q. robur, izolirani na ovaj način, pripadaju uzastopno ponavljajućoj raspršenoj DNA, a prisutni su u genomu u umjerenom broju kopija (300-800). Hibridizacija in situ otkrila je da su ti DNA slijedovi raspoređeni cijelom dužinom gotovo svih kromosoma bez grupiranja na posebnim kromosomskim područjima. Uspoređivanjem ovih DNA slijedova sa već poznatim DNA i aminokiselinskim slijedovima iz GeneBank otkrivena je njihova homologija s poznatim retrotranspozonima. Nadalje, hibridizacija po Southern-u ovih DNA fragmenata na ukupno DNA dodatnih sedam vrsta hrastova, različitih filogenetskih položaja i geografskog porijekla, dali su informaciju o njihovoj divergenciji tijekom genomske evolucije u roda Quercus.

nije evidentirano

nije evidentirano