Preliminarna analiza cDNA biblioteke endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus (CROSBI ID 366110)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Marić, Martina
Ćetković, Helena
Harcet, Matija ; Pleše, Bruna
hrvatski
Preliminarna analiza cDNA biblioteke endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus
Spužve (Porifera) su najjednostavnije životinje koje su se prve odvojile od zajedničkog razvojnog stabla Metazoa. Prve sustavne studije gena i genoma spužava pokazale su da spužve imaju kompleksan genom koji je postojao već kod zajedničkog pretka svih životinja (Urmetazoa). Molekularno-genetička karakterizacija i rekonstrukcija filogenije endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus isključuju pripadnost ove spužve rodu Eunapius, te ukazuju na postojanje bitne nepodudarnosti klasične taksonomije spužava s onom dobivenom molekularno-genetičkim metodama. Nasumičnim sekvenciranjem cDNA (eng. complementary DNA) biblioteke spužve E. subterraneus stvorena je preliminarna baza EST-ova (eng. expressed sequence tags). Korištenjem niza bioinformatičkih alata EST-ovi su analizirani s ciljem produbljivanja spoznaja o značajkama gena i proteina spužava usporedbom s genima/proteinima drugih organizama. Potvrđena je hipoteza da je složenost genoma svojstvo koje je bilo prisutno već kod zajedničkog pretka svih životinja i da postoji iznenađujuće velika sličnost između proteina spužve i čovjeka. Pretragom cDNA biblioteke izdvojena je kompletna cDNA koja kodira za selenoprotein W. Analiza primarne strukture pokazala je veliku sačuvanost kodirajuće regije i SECIS motiva u nekodirajućoj regiji.
Eunapius subterraneus; spužva; selenoprotein W; evolucija
nije evidentirano
engleski
Preliminary analysis of cDNA library from endemic stygobitic sponge Eunapius subterraneus
nije evidentirano
Eunapius subterraneus; endemic sponge; selenoprotein W; evolution
nije evidentirano
Podaci o izdanju
60
16.09.2011.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb