Dokazivanje herpes simplex virusa metodom lančane reakcije polineraze u epidrmalnim i genitalnim brisevima i cerebrospinalnom likvoru pacijenata (CROSBI ID 332181)
Ocjenski rad | magistarski rad (mr. sc. i mr. art.)
Podaci o odgovornosti
Merle Broketa, Martina
Mlinarić-Galinović, Gordana
hrvatski
Dokazivanje herpes simplex virusa metodom lančane reakcije polineraze u epidrmalnim i genitalnim brisevima i cerebrospinalnom likvoru pacijenata
Ispitana je učinkovitost lančane reakcije polimeraze (PCR) i neradioaktivnog obilježavanja DNA hibrida u detekciji Herpes simpleks virusa (HSV) iz 34 klinička uzorka. HSV je u uzorcima detektiran standardnim virološkim tehnikama (DTFA metodom, izolacijom na staničnim kulturama i DTFA tipizacijom). Nakon što je iz staničnih kultura (HeLa i GMK) inficiranih sa HSV-1 i HSV-2 virusom, uz pomoć fenola i kloroforma izolirana DNA, specifični DNA fragment umnožen je PCR metodom pri čemu su korištene specifične oligonukleotidne početnice. Amplifikacijski produkti elektroforetski su razdvojeni na 2%-tnom agaroznom gelu i ukoliko su bili prisutni, obilježena je specifična HSV DNA proba. DNA proba je obilježena nasumičnim ubacivanjem digoksigeninom obilježenog deoksiuridin trifosfata (DIG-dUTP). Napravljeni su Southern transfer i dot- blot na pozitivno nabijenu najlonsku membranu (Boehringer Mannheim Nylon Membran). Nakon hibridizacije digoksigeninom obilježene DNA probe i ciljane DNA, hibridi su detektirani imunološko-enzimatskom metodom koja koristi konjugat protutijela i odgovarajuću enzimom kataliziranu reakciju bojenja. HSV DNA je uspješno umnožena i detektirana u supernatantu staničnih kultura inficiranih sa HSV, a nije detektirana u supernatantu kliničkih uzoraka, što se može objasniti širenjem virusa iz stanice u stanicu i činjenicom da ne dolazi do nakupljanja virusa u međustaničnim prostorima. HSV DNA detektirana je i direktno u dva klinička uzorka. U usporedbi sa standardnim virološkim metodama osjetljivost PCR reakcije bila je 92%, a specifičnost 100%.
herpes simpleks virus (HSV); lančana reakcija polimeraze/ polymerasa chain reaction- PCR/; obiježavanje DNA digoksigeninom (DIG)
nije evidentirano
engleski
DETECTION OF HERPES SIMPLEX VIRUS FROM EPIDERMAL AND GENITAL SWABS AND CEREBROSPINAL FLUID BY POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
nije evidentirano
herpes simplex virus (HSV); polymerase chain reaction (PCR); digoxigenin (DIG)- DNA labelling
nije evidentirano
Podaci o izdanju
112
28.05.1999.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb