Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

ZASTUPLJENOST PALINDROMA U KODIRAJUĆOJ DNA KVASCA Saccharomyces cerevisiae (CROSBI ID 368123)

Ocjenski rad | diplomski rad

Gaćeša, Ranko ZASTUPLJENOST PALINDROMA U KODIRAJUĆOJ DNA KVASCA Saccharomyces cerevisiae / Svetec, Ivan-Krešimir (mentor); Lisnić, Berislav (neposredni voditelj). Zagreb, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, . 2011

Podaci o odgovornosti

Gaćeša, Ranko

Svetec, Ivan-Krešimir

Lisnić, Berislav

hrvatski

ZASTUPLJENOST PALINDROMA U KODIRAJUĆOJ DNA KVASCA Saccharomyces cerevisiae

Dosadašnja istraživanja ukazuju na zaključak da su palindromske sekvencije u molekuli DNA nužne za funkcioniranje genoma jer se često nalaze u cis-djelujućim regijama, ali istovremeno predstavljaju ozbiljnu opasnost za genetičku stabilnost, pri čemu genetička nestabilnost palindroma raste s njihovom duljinom. Ovakva dvojaka biološka uloga palindroma u molekuli DNA potaknula je bioinformatička istraživanja sekvencioniranih genoma s ciljem da se ustanovi broj, duljina i raspored svih palindroma. Međutim, do sada još nije nedvojbeno ustanovljeno da li broj palindroma u nekom genomu odstupa od očekivane vrijednosti, te što bi mogao biti uzrok tom odstupanju. U ovakvim istraživanjima osnovnu prepreku predstavlja upravo određivanje očekivanoga broja palindroma jer na redoslijed nukleotida pa tako i na mogućnost pojave palindroma utječu AT/GC-sastav i „pristrana uporabu kodona“ (eng. codone usage bias) kao i činjenica da genom mora kodirati za odgovarajući proteom. U ovom radu razvijen je računalni program za određivanje očekivanog broja palindroma u kodirajućoj DNA. Ovaj program osniva se na uspoređivanju broja palindroma u zadanoj sekvenciji i u računalno generiranim sekvancijama koje se od zadane sekvencije razlikuju samo po položaju sinonimnih kodona. Rezultati ovog rada jasno ukazuju na zaključak da kodirajuća DNA kvasca S.cerevisiae sadrži manje palindroma nego što bi se to statistički očekivalo te da je zastupljenost palindroma u kodirajućoj DNA u negativnoj korelaciji s razinom ekspresije gena.

kvasac Saccharomyces cerevisiae; palindrom; DNA; genom; sinonimni kodoni; ekspresija gena

nije evidentirano

engleski

DISTRIBUTION OF PALINDROMIC SEQUENCES IN CODING DNA OF YEAST Saccharomyces cerevisiae

nije evidentirano

synonymous codons; palindrome; yeast Saccharomyces cerevisiae; gene expression

nije evidentirano

Podaci o izdanju

37

04.11.2011.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Prehrambeno-biotehnološki fakultet

Zagreb

Povezanost rada

Biotehnologija