hrvatski

Vizualizacija makromolekula

Brzim razvojem računala te znatnim porastom baze podataka poznatih struktura proteina, svoju veliku primjenu našli su i programi za određivanje prianjanja proteina. U sklopu takvih programa nužno je omogućiti uvid u izgled molekula koje proučavamo. Alat razvijen za ovaj završni rad služi vizualizaciji makromolekula. On omogućuje četiri standardna načina prikaza molekule: kalotni, žičani, model kuglama i štapićima, te prikaz površine molekule. Osim toga, VMol može i rekonstruirati površinu dobivenu sfernim harmonicima. Svi načini prikaza su detaljnije pojayšnjeni u poglavljima ovog završnog rada. Ulazne podatke alat dobiva iz zadane PDB datoteke, i datoteke koja sadrži binarni grid. Osim prikaza molekule, VMol daje i informacije o odabranom atomu, aminokiselini, lancu te sferno-polarnim značajkama površine. Na kraju ovog rada prikazano je i testiranje programa sa različitim ulaznim podatcima, čime se pokazuje ispravnost korištenih postupaka, te demonstriraju mogućnosti VMol-a

protein; prianjanje; molekula; vizualizacija; prikaz; kalotni model; žičani model; kugle i štapići; povrišina molekule; grid; Marching cubes; rekonstrukcija; CPK; PDB; atom; radijus; aminokiselina; lanac; elevacija; inklinacija

nije evidentirano