Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Orthobalancer: aplikacija za kreiranje skupova bioloških vrsta usporedive taksonomske širine (CROSBI ID 372984)

Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad

Slijepčević, Ivan Orthobalancer: aplikacija za kreiranje skupova bioloških vrsta usporedive taksonomske širine / Šikić, Mile (mentor); Mihalek, Ivana (neposredni voditelj). Zagreb, Fakultet elektrotehnike i računarstva, . 2012

Podaci o odgovornosti

Slijepčević, Ivan

Šikić, Mile

Mihalek, Ivana

hrvatski

Orthobalancer: aplikacija za kreiranje skupova bioloških vrsta usporedive taksonomske širine

OrthoBalancer mrežna aplikacija za ulaz uzima skup od n bona fide paralognih — sličnih, ali kodiranih različitim genom — proteinskih sekvenci iz iste vrste. Za svaki paralog, aplikacija vraća skup najsličnijih proteina iz drugih vrsta prisutnih u ishodišnoj bazi podataka. U jezgri aplikacije je modul koji koristi taksonomsko stablo živog svijeta kako bi pronašao zajednički podskup n skupova vrsta, ali ipak dozvoljavajući razinu neizrazitosti ili „zamjenjivosti” srodnih vrsta. Stupanj zamjenjivosti, odnosno razina u taksonomskom stablu ispod koje bilo koja vrsta može poslužiti kao reprezentant pripadajućeg podstabla, se može podesiti od strane korisnika.

homologija ; taksonomsko stablo živog svijeta ; FASTA ; neredundantna baza ; mrežna aplikacija ; Python ; jQuery ; AJAX

nije evidentirano

engleski

Orhobalancer: web application for creation of taxonomically balanced sets of orthologous protein sequences

nije evidentirano

homology ; taxonomy tree ; FASTA ; nonredundant database ; web application ; Python ; jQuery ; AJAX

nije evidentirano

Podaci o izdanju

37

29.06.2012.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zagreb

Povezanost rada

Biologija, Računarstvo