Modeliranje genske regulacijske mreže pomoću hibridnog koevolucijskog algoritma (CROSBI ID 374123)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Komlen, Danko
Jakobović, Domagoj
hrvatski
Modeliranje genske regulacijske mreže pomoću hibridnog koevolucijskog algoritma
Modeliranje genskih regulacijskih mreža trenutno je aktivno podruˇcje istraživanja iz sustavne biologije. Napredak na tom podruˇcju omogu´cuje bolje razumijevanje stani ˇcnih procesa i njihovu kontrolu. Algoritmi evolucijskog raˇcunanja primjenjuju se za pronalaženje optimalnih parametara modela. U radu je dana usporedba ˇcetiri algoritma: DE, GA, PSO te Hibridni Hook-Jeeves GA uz korištenje linearnog vremenski promjenjivog modela. Zbog porasta broja parametara kod mreža s ve´cim brojem gena primijenjena je suradniˇcka koevolucija uz dvije vrste podjele problema. Nakon odabira parametara za svaki od algoritama, ispitivanja su vršena nad dva umjetno generirana i jednim stvarnim podatkovnim skupom. Primjena koevolucije pokazala se uspješnom kod svih algoritama osim kod PSO. U radu su opisani korišteni algoritmi i modeli, dan je kra´ci pregled koevolucijskih algoritama te je opisano implementirano EvoGRN programsko okruženje.
genske regulacijske mreže; hibridni genetski algoritam; suradniˇcka koevolucija; linearan vremenski promjenjiv model; S-sustavi
nije evidentirano
engleski
Inference of gene regulatory networks using hybrid coevolutionary algorithm
nije evidentirano
gene regulatory networks; hybrid genetic algorithm; cooperational coevolution; linear time-variant model; S-systems
nije evidentirano
Podaci o izdanju
59
26.09.2012.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb