hrvatski

Moć jakog zasjenjenja magnezijevih protuiona: DNA ostaje u konformacij dvostruke uzvojnice i u granici niske slanosti

Prethodno je izučavan utjecaj jednovalentnih natrijevih protuiona na stabilnost dvostruke uzvojnice DNA[1]. Velika gustoća naboja, 1e- /0.34nm, pojedinog lanca DNA uzrokuje repulziju među njima koja je u kompeticiji s privlačnim vodikovim vezama i slaganjem baza (eng. base stacking). Bez zasjenjenja protuionima iz otopine repulzija bi dominirala te bi došlo do razdvajanja lanaca-denaturacije. Očekuje se da dvovalentni magnezijevi protuioni uslijed jačeg zasjenjenja više smanjuju repulziju među lancima DNA te čine konformaciju dvostruke uzvojnice stabilnijom nego jednovalentni natrijevi protuioni. Eksperimentalno smo to i pokazali izmjerivši različite koncentracijske ovisnosti karakterističnih skala. Jedna od njih je i korelacijska duljina koja govori o udaljenosti međusobno isprepletenih lanaca DNA u otopini. Ona ukazuje da Mg protuioni čuvaju DNA u konformaciji dvostruke uzvojnice sve do najniže koncentracije na kojoj je eksperiment proveden, 0.01 mM. Istovremeno s Na protuionima DNA već za koncentraciju od 0.3 mM pokazuje dinamičko otvaranje[1]. Uzorke Mg-DNA smo pripremili dijalizom Na-DNA (Sigma D1626) prosječne duljine 4000 nm prema MgCl_2. Uzorci su karakterizirani induktivno vezanom plazmom- emisijom atomskih spektara ICP- AESom, te UV spektrofotometrijom. Dielektrična spektroskopija u rasponu frekvencija od 100Hz-100 MHz je napravljena na uzorcima u rasponu koncentracije 0.01 mM- 5 mM u čistoj vodi te u dodanoj soli. 1. S Tomić, S. Dolanski Babić, T. Vuletić, S. Krča, D. Ivanković, L. Griparić, R. Podgornik, Phys. Rev. E 75, 021905 (2007).

DNA; korelacijuska duljina; dielektrična spektroskopija

nije evidentirano