Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Varijabilnost sekvence kontrolne regije mitohondrijske DNA autohtonih hrvatskih pasmina goveda (CROSBI ID 394004)

Ocjenski rad | doktorska disertacija

Paprika, Saša Varijabilnost sekvence kontrolne regije mitohondrijske DNA autohtonih hrvatskih pasmina goveda / Ivanković, Ante (mentor); Zagreb, Agronomski fakultet, . 2015

Podaci o odgovornosti

Paprika, Saša

Ivanković, Ante

hrvatski

Varijabilnost sekvence kontrolne regije mitohondrijske DNA autohtonih hrvatskih pasmina goveda

Autohtone hrvatske pasmine goveda dio su nacionalnog, regionalnog i globalnog genetskog naslijeđa. Budući da su radi gospodarskog zapostavljanja dovedene na rub opstanka, tijekom minula tri desetljeća poduzeti su značajni napori u njihovu očuvanju kroz in situ i ex situ programe konzervacije. Dodatno, interes javnosti za očuvanjem autohtonih hrvatskih pasmina potiče pozitivne populacijske trendove radi očuvanja ukupne genetske raznolikosti. Tri autohtone pasmine goveda (buša, istarsko govedo, slavonsko srijemski podolac) u statusu su neposredne ugroženosti. Upoznavanje gentske strukture pasmina uključenih u programe zaštite pomaže u razumijevanju njihove gentske strukture te unutar i međupopulacijskih filogenetskih odnosa. Filogenetske studije izvornih pasmina goveda temeljene na mitohondrijskoj DNA pogodne su za istraživanje interakcije evolucijskih procesa, posebice migracija i mutacija i njihova učinka na genetsku raznolikost. Analizom uzorka od 146 jedinki tri autohtone pasmine goveda (49 buša, 50 istarskih goveda i 47 slavonsko srijemskih podolaca) utvrđeno je 28 različitih haplotipova od kojih je 25 pasminski specifično te tri haplotipa koje dijeli više pasmina. Svi haplotipovi pripadaju T makrohaplogrupi. Među podhaplogrupama najzastupljanija je T3 haplogrupa, a u niskoj frekvenciji uočeni su haplotipovi svrstani u T2 i T5 haplogrupe. Udio pasminski specifičnih haplotipova je visok, što upućuje na zaključak da su hrvatske autohtone pasmine goveda uglavnom sačuvale osobitu genetsku konstituciju mtDNA, odnosno specifične haplotipove. Pojavnost haplotipova T2 haplogrupe u populaciji istarskog goveda upućuje na razvoj dijela populacije na tragu ''mediteranske migracijske rute'', dok zapažanja haplotipova T5 haplogrupe mtDNA u populaciji slavonsko srijemskog podolca ukazuju da je razvijan na tragu ''podunavske'' te u manjoj mjeri ''mediteranske migracijske rute''. U pogledu genetske udaljenosti istraženih autohtonih pasmina najmanja genetska udaljenost uočena je između populacija slavonsko srijemskog podolca i buše (0, 0035). S obzirom na brojnost i distribuciju haplotipova u populaciji buše uočena je visoka genetska varijabilnost maternalne komponente. Slavonsko srijemski podolac, brojnošću najmanja populacija očuvala je najnižu razinu varijabilnosti maternalne genetske komponete. Analiza molekularne varijance ukazuje na hijerarhijsko grupiranje istraženih populacija u dvije skupine, podolsku i brachicernu te da 15, 57% ukupne genetske raznolikosti čini međupopulacijska raznolikost, a 85, 66% unutarpopulacijska raznolikost. Geografska rasprostranjenost (areal uzgoja) autohtonih pasmina goveda značajno je utjecala na razinu očuvane genetske varijabilnosti. Aktualno stanje populacije buše ukazuje na znatnu fragmentiranost uzgoja te potrebu pozornijeg sparivanja linija i rodova kako bi smanjili gubitak raznolikosti na najmanju moguću razinu. Genetska raznolikost populacije istarskog goveda bolje je očuvana nego u populaciji slavonsko srijemskog podolca. Rezultati istraživanja upućuju na značajan gubitak genetske raznolikosti slavonsko srijemskog podolca uslijed efekta ''uskog grla'' što nalaže potrebu pozorne provedbe uzgojnog programa te uključivanje spoznaja o mtDNA u sheme sparivanja. U cilju minimiziranja razine uzgoja u srodstvu opravdana je ograničena introdukcija gena pasmina podolske skupine, iz filogenetski bližih uzgoja, uz uvažavanje spoznaja o genetskom profilu jedinki.

autohtone pasmine; goveda; mitohondrijska DNA; genotipizacija; filogenetski odnosi; haplotipovi

nije evidentirano

engleski

Variability of mitochondrial DNA control region sequence of autochthonous Croatian cattle breeds

nije evidentirano

autochthonous cattle breeds; mitochondrial DNA; genotyping; phylogenetic relationships; haplotypes

nije evidentirano

Podaci o izdanju

100

23.01.2015.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Agronomski fakultet

Zagreb

Povezanost rada

Poljoprivreda (agronomija)