hrvatski

RAČUNALNA STUDIJA NOVIH CIKLIČIH UREA KAO POTENCIJALNIH INHIBITORA HIV-1 PROTEAZE

Poznati su mnogi inhibitori HIV proteaza posebice inhibitori HIV-1 proteaza. Idinavir, sekvinavir i ritonavir samo su neki primjeri poznatih inhibitora HIV-1 proteaza. Derivat sedmeročlane cikličke uree, 1, 3-diazepinske strukture, koji smo uzeli kao spoj uzor, ima inhibitorno djelovanje na HIV- 1 proteazu u niskom nanomolarnom području koncentracija (1). U ovom radu, naglasak je stavljen na dizajniranje potencijalnih inhibitora HIV-1 proteaza, te računalne studije osam derivata cikličkih urea. Cilj rada je bio promijeniti strukuru spoja uzora, prikazati potencijalne derivate i računalnim simuliranjem pokušati predvidjeti povoljna svojstva novih derivata. Ključni parametri za modeliranje su potencijalno biološko djelovanje, volumen molekula, ukupna polarna površina i molarna topljivost. Pomoću programa PharmMapper (2) procijenjeno je proteazno djelovanje. Volumen molekula i ukupna polarna površina (TPSA) preuzeti su iz programa Molinspiration (3). Određivanje molekulskog volumena temelji se na doprinosu pojedinih skupina u molekuli, a TPSA je ključni parametar za predviđanje biološke raspoloživosti. Pomoću programa Osiris (4) procijenja je vrijednost log S - negativna vrijednost logaritma topljivosti spoja (u mol/L). Temeljem izračuna u programu MolSoft (5) utvrđeno je da pet novih spojeva većinom zadovoljavaju Lipinskijeva pravila. Optimalne vrijednosti navedenih parametara bile su u sljedećem rasponu: predviđeno inhibitorno proteazno djelovanje između -0.81 do -0.40, volumen molekula od 661.20 do 675.78 Å3 , TPSA oko 147.98 Å2 i molarna topljivost od -8.88 do -7.23. Dobiveni rezultati ukazuju na visok potencijal inhibicije HIV- 1 proteaze predloženim cikličkim ureama te je rezultate potrebno potvrditi sintezama i biološkim ispitivanjima najboljih kandidata. 1. P. K. Jadhav, P. Ala, F. J. Woerner, C. H. Chang, S. S. Garber, E. D. Anton, L. T. Bacheler, J. Med. Chem. 40 (1997) 181-191. 2. X. Liu, S. Ouyang, B. Yu, K. Huang, Y. Liu, J. Gong, S. Zheng, Z. Li, H. Li, H. Jiang, Nucleic Acids Res. 38 (2010) 609-614. 3. http://www.molinspiration.com/services/properties.html pristupljeno 15.1.2015. 4. http://www.organic-chemistry.org/prog/peo/ pristupljeno 15.1.2015. 5. http://www.molsoft.com/mprop/ pristupljeno 15.1.2015.

QSAR; HIV-1 inhibitori proteaze

nije evidentirano