In silico probir derivata kumarina i L- askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 — pametni dizajn novih kemoterapeutika (CROSBI ID 410840)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Ister, Rok
Verbanac, Donotella
Stepanić, Višnja
hrvatski
In silico probir derivata kumarina i L- askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 — pametni dizajn novih kemoterapeutika
Razvoj novih lijekova podrazumijeva dugotrajan i skup proces. Uključivanje stručnjaka iz svih područja omogućuje smanjivanje rizika od gubitka potencijalno kvalitetnih molekula tijekom tog procesa, te su danas interdisciplinarni timovi imperativ za osiguravanje uspješnosti i brzine odvijanja samog tijeka istraživanja i razvoja novih terapijskih opcija. Budući da je razvoj novih tehnologija i kompjuterskih/računskih programa omogućio relativno uspješno predviđanje ponašanja molekula u biološkim sustavima, te je doprinio i ukupnom smanjenju troškova razvoja, upotreba računalne kemije danas je od velikog značaja i uvelike se koristi u farmaceutskoj industriji i u ostalim sustavima koji se bave problematikom iznalaženja novih obećavajućih molekula. U ovom radu je sa skupom novosintetiziranih hibridnih spojeva (33 kumarinsko-1, 2, 3- triazolna i 61 askorbinsko -1, 2, 3-triazolna derivata) provedeno molekularno uklapanje na poznatoj ciljnoj molekuli enzimu, LSD1 (lizin- specifičnoj demetilazi 1) kako bi se između navedenog skupa spojeva probrale aktivne molekule i pokušao pretpostaviti mehanizam njihove inhibicije ciljanog enzima koji sudjeluje u epigenetskoj regulaciji stanice. LSD1 igra vrlo važnu ulogu u modifikaciji epigenetskog izražaja stanice uklanjajući metilne skupine s lizina na histonskim podjedinicama i pojačano je izražen u neoplastičnim stanicama određenih vrsta tumora. Model je postavljen koristeći poznate reverzibilne inhibitore LSD1 i pomoću određenih graničnih vrijednosti između aktivnih i neaktivnih spojeva probran je podskup spojeva za daljnja in vitro testiranja. Također, metodom definicije dva vezna mjesta predloženi su strukturni mehanizmi inhibicije otvarajući time mogućnost pametnog dizajniranja novih lijekova u bliskoj budućnosti koji ciljaju na enzim LSD1 kao mjesto djelovanja.
askorbinska kiselina ; in silico ; kemoterapija ; kumarin ; lizin-specifična demetilaza 1 ; molekularno uklapanje ; virtualni probir
nije evidentirano
engleski
In silico screening of coumarin and L-ascorbic acid derivatives on histone demethylase LSD1 - rational design of novel chemotherapeutics
nije evidentirano
ascorbic acid ; chemotherapy ; coumarin ; in silico studies ; lysine-specific demetilaze 1 ; molecular docking ; virtual screening
nije evidentirano
Podaci o izdanju
52
13.07.2018.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Medicinski fakultet u Zagrebu
Zagreb