Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Ručno određivanje lažnih preklapanja koja nastaju pri sastavljanju genoma (CROSBI ID 411197)

Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad

Floreani, Filip Ručno određivanje lažnih preklapanja koja nastaju pri sastavljanju genoma / Šikić, Mile (mentor); Zagreb, Fakultet elektrotehnike i računarstva, . 2017

Podaci o odgovornosti

Floreani, Filip

Šikić, Mile

hrvatski

Ručno određivanje lažnih preklapanja koja nastaju pri sastavljanju genoma

Proces sastavljanja genoma temeljen je na analizi preklapanja kratkih očitanja genetskog materijala. Zbog očitanja loše kvalitete, kao i zbog prisutnosti kimernih i ponavljajućih očitanja, osim ispravnih preklapanja pojavljuju se i lažna preklapanja. Detekcija lažnih preklapanja ključna je u postizanju boljeg konačnog rezultata. Jedna od metoda detekcije je generiranje 1D-signala temeljenog na izračunu broja preklapanja svake nukleinske baze pojedinog očitanja, koji se potom prikazuje u obliku grafa. Kroz ovaj rad predstavljeno je aplikacijsko rješenje za Android uređžaje, kojim je moguće označiti regije u kojima se pojavljuju lažna preklapanja, kao i sortirati grafove po predefiniranim kategorijama. U radu je data teorijska osnova rješenja, kao i detalji njegove implementacije i konačnog ispitivanja.

Lažna preklapanja, kimerna očitanja, ponavljajuća očitanja, sastavljanje genoma, Android, bioinformatika

nije evidentirano

engleski

Manual detection of false overlaps occurring during genome assembly

nije evidentirano

False overlaps, chimeric reads, repeating reads, genome assembly, Android, bioinformatics

nije evidentirano

Podaci o izdanju

31

04.07.2017.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zagreb

Povezanost rada

Računarstvo