Kondenzacija dugih DNA molekula: snopovi, klupka, užad i čvorovi (CROSBI ID 653998)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | domaća recenzija
Podaci o odgovornosti
Šiber, Antonio
hrvatski
Kondenzacija dugih DNA molekula: snopovi, klupka, užad i čvorovi
DNA molekule nose u fiziološkim uvjetima velik naboj, veći od jednog negativnog elementarnog naboja po baznom paru. Zbog elektrostatskog samo-odbijanja koje je posljedica rasporeda naboja duž molekule, potrebne su velike sile da se DNA komprimira u mali volumen. Ipak, svaka od naših stanica sadrži velike količine DNA i to u vrlo malom prostoru stanične jezgre. Komprimacija DNA u organizmima moguća je zahvaljujući posebnim proteinima koji su evoluirali upravo za tu potrebu. U slučaju viših organizama radi se o izrazito pozitivnim proteinima koje zovemo histonima i koji kompaktiraju DNA u kromosome. Premda bakterije nemaju jezgru, i kod njih postoje specifični proteini namijenjeni kompakciji DNA genoma. Virusi i bakterije, pored specifičnih proteina, često u te svrhe koriste i mnogovalentne pozitivne ione (npr. poliamine). Takvi kondenzacijski agensi mogu dovesti DNA u stanje samo-privlačenja, odn. DNA kondenzacije u kojoj je energetski povoljno da dijelovi DNA vrpce budu jedni uz druge, stvarajući tako snopove DNA. No, kako je, npr. u virusima, DNA tipično u jednom dugom komadu, usnopljavanje DNA mora biti nužno korelirano s mezoskopskim oblikom DNA koji npr. može sličiti torusu unutar kojeg je ista vrpca višestruko namotana. U predavanju će se posebno razmotriti oblici kondenzirane DNA molekule unutar virusa te način na koji prostorno ograničenje utječe na te oblike [1]. [1] A. Šiber "Shapes of minimal-energy DNA ropes condensed in connement", Sci. Rep. 6, 29012 (2016).
virus, DNA, elastičnost, bakteriofag, kondenzacija, čvor
nije evidentirano
engleski
Condensation of long DNA molecules: bundles, spools, ropes and knots
nije evidentirano
virus, DNA, elasticity, bacteriophage, condensation, knot
nije evidentirano
Podaci o prilogu
19-19.
2017.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva: knjiga sažetaka
Vernesa Smolčić, Ticijana Ban, Ante Bilušić, Vlasta Horvatić, Vibor Jelić, Marin Karuza, Marko Kralj, Krešimir Kumerički, Fabrizio Nesti, Denis Stanić
Zagreb: Hrvatsko fizikalno društvo
978-953-7178-21-5
Podaci o skupu
Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva
pozvano predavanje
11.10.2017-13.10.2017
Baška, Hrvatska