hrvatski

Molekulska dinamika antimikrobnih peptida

Istraživanje bioloških procesa nameće interdisciplinarni pristup, te usporedbu rezultata različitih metoda i tehnika mjerenja. Značajan je doprinos metode molekulske dinamike, iako ograničen modelima polja sila i dostupnom prostornom-vremenskom skalom. U ovom radu predstavit ćemo rezultate simulacija molekulske dinamike međudjelovanja antimikrobnih peptida s modelnim biološkim membranama [1]. Naime, gorući globalni zdravstveni problem je sve veća otpornost bakterijskih sojeva na standardne antibiotike, te antimikrobni peptidi, s nespecifičnim mehanizmom djelovanja su moguća alternativa. Za dizajn novih antimikrobnih peptida, koji bi imali dobro antibiotsko djelovanje, ključno svojstvo jest selektivnost, visoka aktivnost prema bakterijskim stanicama i smanjena toksičnost prema eukariotima. Ovaj uvjet nije lako ispuniti, te je u kliničkoj upotrebi, samo tzv. ’last resort’ antibiotik, peptid colistin. Selektivnost može biti definirana svojstvima peptida, ali i svojstvima membrane. Na primjeru, novo dizajniranih antimikrobnih peptida nazvanih Kiadini, opisat će se fizikalno-kemijska svojstva peptida koji promiču bolju aktivnost. Predstavit će se rezultati simulacija djelovanja maculatina 1.1 i modela membrana za eukariotske i bakterijske stanice te opisati kako svojstva lipida koji grade membranu utječu na selektivnost i aktivnost peptida. Napravit će se poveznice simulacijskih rezultata s mjerenjima strukture, te biološkim i biofizikalnim mjerenjima aktivnosti i citotoksičnosti. [1] T. Rončević, et al. PGLa-H tandem-repeat peptides active against multidrug resistant clinical bacterial isbolates. BBA Biomembranes, 1859 (2) (2017) 228-237.

antimikrobni-peptidi ; molekularna-dinamika ; kiadini ; maculatin

nije evidentirano