hrvatski

Približni algoritam za brzo računanje poravnanja dvaju dugačkih nizova

Globalno poravnanje genoma važan je problem genomike. Zbog duljine genoma, računanje optimalnog puta poravnanja točnim algoritmima dinamičkog programiranja računalno je neizvedivo. Cilj ovog rada predstavljanje je i implementacija heurističkog algoritma poravnanja temeljenog na tehnikama traženja predstavnika i procjene Jaccardovog koeficijenta sličnosti skiciranjem. U poglavlju 2 dan je popis pretpostavki neophodnih za rad algoritma te popis pojmova za pomoć pri njegovom razumijevanju. Poglavlje 3 iznosi formalnu definiciju problema, a konkretan algoritam razvijen za njegovo rješavanje opisan je poglavljem 4. Implementacijski specifični detalji nevažni za opis algoritma na visokoj razini navedeni su u poglavlju 5. Rezultati i učinkovitost implementiranog algoritma istraženi su u poglavlju 6. Konačno, poglavlje 7 ukratko izdvaja najbitnije ideje rada.

MinHash, Jaccard, Winnowing, Predstavnik, Skiciranje, Poravnanja dugih očitanja

nije evidentirano