Karakterizacija proteinskih kompleksa proteina SSB (CROSBI ID 425963)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Kostelac, Anja
Vujaklija, Dušica ; Ivančić-Baće, Ivana
Godinić Mikulčić, Vlatka
hrvatski
Karakterizacija proteinskih kompleksa proteina SSB
Streptomiceti predstavljaju najbrojniji rod unutar koljena Actinobacteria. Bakterija Streptomyces coelicolor A3(2) je modelni organizam za proučavanje procesa stanične diferencijacije i proizvodnje antibiotika kod bakterija. Genom ove bakterije ima dva gene, ssbA i ssbB za proteine koji vežu jednolančanu molekulu DNA (SSB), a sudjeluju u različitim procesima metabolizma DNA. Također ima i dva gena, hupA i hupS, koji kodiraju za proteine HU. Ovi proteini su združeni s nukleoidom i važni su za očuvanje strukture i integriteta DNA unutar stanice. Protein HU je potencijalni proteinski partner proteina SsbA. U ovom je radu, proteini SsbA i HupS prekomjerno su eksprimirani u heterolognom domaćinu, bakteriji Escherichia coli u svrhu pročišćavanja veće količina proteina. Za potrebe ispitivanja kompleksa SSB:HU ispitane su interakcije protein-DNA proteina SsbA i SsbB s jednolančanom DNA. Rezultati su pokazali da protein SsbB ima prosječno dva puta veći afinitet prema jlDNA nego protein SsbA, te da nastajanje kompleksa SsbB:jlDNA ne ovisi značajnije o prisutnosti soli u odnosu na kompleks SsbA:jlDNA. Pokazano je da je nastajanje kompleksa SsbA:HU spontana reakcija s visokom konstantom disocijacije i da je vođena hidrofobnim interakcijama. Interakcija između proteina SsbA i HU se ostvaruje bez prisustva jlDNA, dok se konformacijska promjena uočava samo na proteinu HU.
Streptomyces coelicolor ; protein SSB ; protein HU ; jednolančana DNA ; interakcije
nije evidentirano
engleski
Characterisation of SSB protein complexes
nije evidentirano
Streptomyces coelicolor ; SSB protein ; HU protein ; single-stranded DNA ; interactions
nije evidentirano
Podaci o izdanju
74
18.02.2019.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb, Hrvatska