Metil-transferaza Sgm iz bakterije Micromonospora zionensis pripada porodici enzima Arm čiji članovi uzrokuju visoku rezistenciju na aminoglikozide. Ti su se enzimi donedavno mogli naći isključivo u prirodnim proizvođačima aminoglikozida, no nedavno su nađeni i u kliničkom okruženju. Ispitivanje mehanizma djelovanja ovih enzima nužno je za sprečavanje ovog vrlo opasnog vida bakterijske rezistencije. U našem prijašnjem radu modelirali smo strukturu proteina Sgm i analizirali odnos između njegovog slijeda, strukture i funkcije metodama ograničene proteolize i mutageneze. U ovom radu odredili smo mjesto metilacije enzima Sgm kao i njegov supstrat. Istražili smo kako pojava ovog enzima utječe na eksponencijalni rast E. coli i njihovu sposobnost natjecanja sa stanicama koje ga ne eksprimiraju. Pokazali smo kako su podjedinice 30S supstrat enzima Sgm, za razliku od cijelih ribosoma ili gole rRNA. Metodama produljenja ishodnice i MALDI-TOF MS utvrdili smo kako se metilacija odvija na nukleotidu G1405 u 16S rRNA. Pokazali smo i kako su ribosomi u potpunosti modificirani u stanicama koje eksprimiraju Sgm. Isto tako, stanice E. coli koje eksprimiraju Sgm rastu sporije od stanica bez tog enzima. Naši rezultati postavit će temelj za složenija istraživanja mehanizma reakcije i elemenata prepoznavanja u 16S rRNA. Te će spoznaje pomoći u pronalasku specifičnog inhibitora enzima iz porodice Arm i tako nadvladati rezistenciju na aminoglikozidne antibiotike temeljenu na metilaciji ribosoma.

Biology