engleski

Microarray analysis of global gene expression in osteocytes versus osteoblasts isolated from mouse neonatal calvaria tissue

Osteociti su najbrojnija stanična komponenta unutar koštanog tkiva. Unatoč tome malo se zna o procesu diferencijacije osteocita iz osteoblasta i njihovog daljnjeg funkcionalnog sazrijevanja. Odredjivanje ekspresijskog obrasca i utvrđivanje uloge pojedinanih gena koji stoje u pozadini tog procesa, bitan je preduvjet za njegovo bolje razumijevanje. To može dovesti do otkrića novih regulacijskih gena i pogodnih molekularnih biljega specifičnih za pojedine stadija razvojne loze osteoblasta/osteocita. Time bi se dodatno rasvjetllile funkcionalne interakcije i različiti mehanizmi povratne sprege između osteocita i osteoblasta te drugih koštanih stanica. Heterogena populacija stanica koja obuhvaća sve stadije razvojne loze osteoblasta i druge stanice koštanog tkiva dobivena je enzimskom digestijom kalvarija izoliranih iz neonatalnih transgeničnih miševa u čijim stanicama dolazi do ekspresije dvaju transgeničnih GFP-biljega: DMP1-1GFPtopaz i pOBCol2.3GFPcyan. Iz stanica dobivenih FACS staničnim sorterom izolirana je ukupna RNA, izvršena in vitro transkripcije i obilježavanja cDNA, a globalna ekspresija gena analizirana je korištenjem Illumina’ s MouseWG-6 v.1 BeadChip mikropostroja. Nakon normalizacije i statističke obrade za daljnju analizu odabrani su geni kod kojih je omjer ekspresije u osteocitima povećan odnosno smanjen za više od dva puta u odnosu na ekspresiju u osteoblastima. Odabrani geni analizirani su s obzirom na njihovu biološku funkciju i druge prateće GO termine.

Osteocytes; osteoblasts; microarray; mouse

nije evidentirano