Microarray analiza četiri planocelularna karcinoma grkljana čovjeka (CROSBI ID 496281)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | domaća recenzija
Podaci o odgovornosti
Gall-Trošelj, Koraljka ; Streichert, Thomas ; Pavelić, Krešimir
hrvatski
Microarray analiza četiri planocelularna karcinoma grkljana čovjeka
Tehnologija nanošenja kratkih odsječaka gena na sintetičke podloge, DNA čip, revolucionarizirala je sva područja genetike. Ne postoji područje istraživanja u molekularnoj medicini u kojem ova metoda nije primjenjiva. Još je donedavno bilo nezamislivo da bi se većina transkripata u odabranom biološkom materijalu mogla analizirati istovremeno, u vrlo kratkom vremenu. Uvođenje tehnologije DNA čipa omogućilo je da se, ovisno o broju oligonukleotida na čipu i kvaliteti programa za analizu podataka, jednim pokusom analizira ispoljavanje dvadesetak tisuća gena. Cilj rada: Usporediti obrasce ispoljenih gena u četiri zloćudna planocelularna karcinoma grkljana (2 + 2) čovjeka koji su se razlikovali s obzirom na prisustvo bakterije H. pylori. Metode: Prisustvo H. pylori u analiziranim uzorcima utvrđeno je metodom nested PCR i rutinskom histologijom. Ukupna RNA prepisana je u cDNA a potom je, tijekom ponovnog prepisivanja u cRNA, obilježena biotinom. Fragmentirani odsječci obilježene cRNA hibridizirani su s probama na DNA čipu U-133A, Affymetrix. Rezultati: Usporedba dobivenih rezultata napravljena je korištenjem odgovarajućih programa. Križnom usporedbom dokazan je značajan (najmanje dvostruko) porast aktivnosti za 115 gena, (između ostalih, i gena koji kodiraju neke tipove kolagena), dok je znatno smanjena aktivnost dokazana za 209 gena (velik broj gena iz obitelji mucina.) Zaključak: Iako je prisustvo bakterije H. pylori u zloćudnim tumorima grkljana čovjeka povezano sa značajnom promjenom ispoljavanja velikog broja gena, primijećen je utjecaj na pojedine skupine (“ clusters” ) gena. Pravi značaj većine dobivenih rezultata na našem uzorku nije moguće objasniti na temelju dosadašnjih znanstvenih spoznaja.
karcinom grkljana;
nije evidentirano
engleski
Tha microarray analysis of four laryngeal planocellular carcinomas
nije evidentirano
laryngeal cancer; microarray; Helicobacter pylori
nije evidentirano
Podaci o prilogu
5-5-x.
2003.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Paediatria Croatica
Barišić, Ingeborg
Zagreb: Klinika za dječje bolesti
Podaci o skupu
3. hrvatski kongres humane genetike s međunarodnim sudjelovanjem
predavanje
03.09.2003-04.09.2003
Zagreb, Hrvatska