|
|
|
|
Poglavlja u knjizi
|
|
1. Weygand-Đurašević, Ivana; Cusack, Stephen.
Structure, function and evolution of seryl-tRNA synthetases // Aminoacyl-tRNA Synthetases (Molecular Biology Intelligence Unit) / Ibba, Michael ; Francklyn, Chirstopher ; Cusack, Stephen (ur.).
Georgetown (TX) : Landes Bioscience, 2005.
Str. 177-192.
|
|
|
|
|
|
Izvorni znanstveni i pregledni radovi u CC časopisima
|
|
1. Godinić Mikulčić, Vlatka; Jarić, Jelena; Weygand- Đurašević, Ivana.
Arginyl-tRNA Synthetase Facilitates Complex
Formation Between Seryl-tRNA Synthetase and its
Cognate Transfer RNA. // Croatica chemica acta. 85 (2012) , 4; 441-449 (članak, znanstveni).
|
2. Bilokapić, Silvija; Maier, Timm; Ahel, Dragana; Gruić-Sovulj, Ita; Söll, Dieter; Weygand-Đurašević, Ivana; Ban, Nenad.
Structure of the unusual methanogen seryl-tRNA synthetase reveals a distinct zincdependent mode of substrate recognition. // EMBO Journal. 25 (2006) , 11; 2498-509 (članak, znanstveni).
|
3. Gruić-Sovulj, Ita; Jarić, Jelena; Dulić, Morana; Cindrić, Mario; Weygand-Durašević, Ivana.
Shuffling of Discrete tRNASer Regions Reveals Differently Utilized Identity Elements in Yeast and Methanogenic Archaea. // Journal of molecular biology. 361 (2006) , 1; 128-139 (članak, znanstveni).
|
4. Ahel, Dragana; Slade, Dea; Močibob, Marko; Söll, Dieter; Weygand-Đurašević, Ivana.
Selective inhibition of divergent seryl-tRNA
synthetases by serine analogues. // FEBS letters. 579 (2005) , 20; 4344-4348 (članak, znanstveni).
|
5. Gruić-Sovulj, Ita; Uter, Nathan; Bullock, Timothy; Perona, John.
tRNA-dependent aminoacyl-adenylate hydrolysis by a nonediting class I aminoacyl-tRNA synthetase. // The Journal of biological chemistry. 280 (2005) ; 23978-23986 (članak, znanstveni).
|
6. Ročak, Sanda; Emery, Bertrand; Tanner, Kyle; Linder, Patrick.
Characterization of the ATPase and unwinding activities of the yeast DEAD-box protein Has1p and the analysis of the roles of the conserved motifs.. // Nucleic acids research. 33 (2005) , 3; 999-1009 (članak, znanstveni).
|
7. Uter, Nathan; Gruić-Sovulj, Ita; Perona, John.
Amino acid-dependent transfer RNA affinity in a class I aminoacyl-tRNA synthetase.. // The Journal of biological chemistry. 280 (2005) ; 23966-23977 (članak, znanstveni).
|
8. Weygand-Durašević, Ivana.
Croatian School on tRNA and Aminoacyl-tRNA Synthetases. // Croatica chemica acta. 78 (2005) ; 319-324 (članak, znanstveni).
|
9. Bilokapić, Silvija; Korenčić, Dragana; Söll, Dieter; Weygand-Đurašević, Ivana.
The unusual methanogenic seryl-tRNA synthetase recognizes tRNASer species from all three kingdoms of life. // European Journal of Biochemistry. 271 (2004) , 4; 694-702 (članak, znanstveni).
|
10. Emery, Bertrand; de la Cruz, Jesús; Ročak, Sanda; Deloche, Olivier; Linder, Patrick.
Has1p, a member of the DEAD-box family, is required for 40S ribosomal subunit biogenesis in Saccharomyces cerevisiae. // Molecular microbiology. 52 (2004) , 1; 141-158 (članak, znanstveni).
|
11. Gruić-Sovulj, Ita; Rokov-Plavec, Jasmina; Močibob, Marko; Kamenski, Tomislav; Weygand- Đurašević, Ivana.
Stability of the complex between yeast seryl-
tRNA synthetase and tRNASer under different
electrophoretic conditions. // Croatica chemica acta. 77 (2004) , 4; 599-604 (članak, znanstveni).
|
12. Korenčić, Dragana; Polycarpo, Carla; Weygand-Đurašević, Ivana; Söll, Dieter.
Differential modes of transfer RNASer recognition in Methanosarcina barkeri. // Journal of Biological Chemistry. 279 (2004) ; 48780-48786 (članak, znanstveni).
|
13. Ročak, Sanda; Linder, Patrick.
DEAD-box proteins : the driving forces behind RNA metabolism. // Nature reviews molecular cell biology. 5 (2004) , 3; 232-241 (članak, znanstveni).
|
14. Gruić-Sovulj, Ita; Landeka, Irena; Söll, Dieter; Weygand-Đurašević, Ivana.
tRNA-dependent amino acid discrimination by yeast sery-tRNA synthetases. // European journal of biochemistry. 269 (2002) ; 5271-5279 (članak, znanstveni).
|
15. Lenhard, Boris; Wasserman, Wyeth.
TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. // Bioinformatics. 18 (2002) ; 1135-1136 (članak, znanstveni).
|
16. Okazaki, Y.; Furuno, M.; Kasukawa, T.; Adachi, J.; Bono, H.; Kondo, S.; Nikaido, I.; Osato, N.; Saito, R.; Suzuki, H.; Yamanaka, I.; Kiyosawa, H.; Yagi, K.; Tomaru, Y.; Hasegawa, Y.; Nogami, A.; Schonbach, C.; Lenhard, Boris.
Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60, 770 full-length cDNAs. // Nature. 420 (2002) ; 563-573 (članak, znanstveni).
|
17. Ročak, Sanda; Landeka, Irena; Weygand-Đurašević, Ivana.
Identifying Pex21p as a protein that specifically interacts with yeast seryl-tRNA synthetase. // FEMS microbiology letters. 214 (2002) ; 101-106 (članak, znanstveni).
|
18. Weygand-Đurašević, Ivana; Gruić-Sovulj, Ita; Ročak, Sanda; Landeka, Irena.
The accuracy of seryl-tRNA synthesis. // Food technology and biotechnology. 40 (2002) ; 247-253 (pregledni rad, znanstveni).
|
|
|
|
|
|
Znanstveni radovi u drugim časopisima
|
|
|
|
|
Sažeci u zbornicima skupova
|
|
1. Gruić-Sovulj, Ita.
Accuracy of translation : Lessons from aminoacyl-tRNA synthetases // Kongres hrvatskog društva za biokemiju i molekularnu biologiju prigodom 30. obljetnice osnutka uz međunarodno sudjelovanje : knjiga sažetaka = Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology on the occasion of the 30th Anniversary with international participation : book of abstracts / Kovarik, Zrinka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2006. 38-38 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
2. Bilokapić, Silvija; Maier, Timm, Weygand-Durasevic, Ivana; Ban, Nenad.
STRUCTURE AND FUNCTION OF UNUSUAL ARCHAEAL SERYL-tRNA SYNTHETASE // XX Congress of the International Union of crystallography.
Firenza : München, 2005. (poster,sažetak).
|
3. Bilokapić, Silvija; Maier, Timm; Weygand- Đurašević, Ivana; Ban, Nenad.
Struktura i funkcija atipičnih arhealnih seril-tRNA-
sintetaza // 4. Znanstveni sastanak hrvatskih biofizičara / Pifat-Mrzljak, Greta (ur.).
Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2005. (domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
4. Gruić-Sovulj, Ita; Perona, John.
Hidroliza aminoacil-adenilata u aktivnom mjestu
aminoacil-tRNA-sintetaze razreda I // XIX hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera : Knjiga sažetaka / Rapić, Vladimir ; Rogošić, Marko (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI) ; Hrvatsko kemijsko drustvo, 2005. 75-75 (poster,sažetak,znanstveni).
|
5. Jarić, Jelena; Gruić-Sovulj, Ita; Bilokapić, Silvija; Dulić, Morana; Weygand-Đurašević, Ivana.
Transfer RNA domains responsible for SerRS:tRNASer recognition and serylation in yeast and in methanogenic archaea // 21st Internatinal tRNA Workshop, tRNA - 2005.
Bangalore, 2005. 124 (poster,sažetak,znanstveni).
|
6. Weygand-Đurašević, Ivana.
Dieter, SerRS and Zagreb // Soll Symposium: 40 years of exploring tRNA / Ibba, Michael (ur.).
New Haven (CT) : Yale University, 2005. (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).
|
7. Gruić-Sovulj, Ita; Jarić, Jelena; Weygand- Đurašević, Ivana.
tRNA identity domains in yeast and in methanogenic
archaea // Knjiga sažetaka Kongresa Hrvatskog društva za biokemiju i molekularnu biologiju 2004 / Dumić, Jerka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2004. 81-81 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
8. Lesjak, Sonja; Boko, Draško; Rokov-Plavec, Jasmina; Weygand-Đurašević, Ivana.
Amber suppression in bacterium Escherichia coli
using archaeal ortologous seryl-tRNA // Knjiga sažetaka Kongresa Hrvatskog društva za biokemiju i molekularnu biologiju 2004 / Dumić, Jerka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2004. 81-81 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
9. Ročak, Sanda; Godinić, Vlatka; Landeka, Irena; Močibob, Marko; Weygand-Đurašević, Ivana.
C-terminal extension of yeast SerRS has
important role in tRNA binding and protein-
protein interactions // Kongres hrvatskog društva za biokemiju i molekularnu biologiju / Dumić, Jerka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2004. 77-77 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
10. Ročak, Sanda; Godinić, Vlatka; Landeka, Irena; Weygand-Đurašević, Ivana.
The interaction of yeast seryl-tRNA synthetase with the peroxin // European Journal of Biochemistry / Wilkinson et al. (ur.).
Oxford : Wiley-Blackwell, 2004. 93-93 (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
11. Weygand-Đurašević, Ivana.
Croatian school on tRNA and aminoacyl-tRNA synthetases // Kongres Hrvatskog društva za biokemiju i molekularnu biologiju / Dumić, Jerka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2004. 33-33 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
12. Bilokapić, Silvija; Glavan, Filip; Gruić-Sovulj, Ita; Weygand-Đurašević, Ivana.
Atypical archaeal seryl-tRNA synthetases
recognize
tRNASer determinants from all three domains of
life // 8. Hrvatski biološki kongres / Besendorfer, Višnja (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2003. 68-68 (predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
13. Gruić-Sovulj, Ita; Jarić, Jelena; Weygand-Đurašević, Ivana.
ZAMJENA DOMENA MOLEKULE tRNA DAJE NOVI POGLED NA ELEMENTE IDENTITETA tRNASer U KVASCU I METANOGENOJ ARHEJI // XVIII. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera / Zrnčević, Stanka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2003. 88 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
14. Jarić, Jelena; Gruić-Sovulj, Ita; Weygand- Đurašević, Ivana.
Zamjena domena molekule tRNA daje novi pogled na
elemente identiteta tRNASer u kvascu i metanogenoj
arheji // 2. znanstveni simpozij s međunarodnim sudjelovanjem, 45 godina molekularne biologije u Hrvatskoj, 50 godina dvostruke uzvojnice / Ristov Ambriović, Andreja ; Brozović, Anamarija (ur.).
Zagreb, 2003. 21-21 (poster,sažetak,znanstveni).
|
15. Kućan, Željko.
Forty-five years ago: an eye-witness report // 45 Years of molecular biology in Croatia, 50 years of dobule helix / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2003. 12 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
16. Lesjak, Sonja; Rokov, Jasmina; Landeka, Irena; Weygand-Đurašević, Ivana.
In vivo recognition of eukaryal and bacterial
tRNAsSer by heterologous seryl-tRNA synthetases // 45 Years of molecular biology in Croatia, 50 years of double helix / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2003. 22-22 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
17. Močibob, Marko; Gruić-Sovulj, Ita; Weygand-Đurašević, Ivana.
STABILNOST I STEHIOMETRIJA KOMPLEKSA SERIL-tRNA SINTETAZA I tRNASer // XVIII. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera / Zrnčević, Stanka (ur.).
Zagreb : Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2003. 87 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
18. Močibob, Marko; Gruić-Sovulj, Ita; Weygand-Đurašević, Ivana.
Macromolecular complexes of seryl-tRNA synthetases and tRNA(Ser) explored by native electrophoresis // 45 Years of molecular biology in Croatia, 50 years of double helix / Ambriović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb, 2003. 35 (poster,sažetak,znanstveni).
|
19. Močibob, Marko; Gruić-Sovulj, Ita; Weygand-Đurašević, Ivana.
Macromolecular complexes of seryl-tRNA synthetases and tRNA(Ser) explored by native electrophoresis // Eighth International Summer School on Biophysics, Supramolecular Structure and Function / Pifat-Mrzljak, Greta (ur.).
Zagreb, 2003. 157 (poster,sažetak,znanstveni).
|
20. Ročak, Sanda; Godinić, Vlatka; Landeka, Irena; Weygand-Đurašević, Ivana.
Protein co-factor of yeast seryl-tRNA synthetase // 8. Hrvatski biološki kongres / Besendorfer, Višnja (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2003. 75-75 (poster,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
21. Rokov Plavec, Jasmina; Ročak, Sanda; Gruić-Sovulj, Ita; Landeka, Irena; Lesjak, Sonja; Jarić, Jelena; Močibob, Marko; Bilokapić, Silvija; Weygand-Đurašević, Ivana.
Seryl-tRNA syntheases: Structure, function and
evolution across all three domains of life // 8. Hrvatski biološku kongres / Besendorfer, Višnja (ur.).
Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2003. 60-60 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
22. Weygand-Đurašević, Ivana.
Detekcija i uloga novih makromolekularnih kompleksa u biosintezi proteina // 3. znanstveni sastanak hrvatskih biofizičara / Svetličić, V ; Lučić, B. (ur.).
Zagreb, 2003. 3 (pozvano predavanje,sažetak,znanstveni).
|
23. Weygand-Đurašević, Ivana.
Serylation in protein biosynthesis: trials, facts and excitements in the last decade // 45 Years of molecular biology in Croatia, 50 years of double helix / Ambrimović Ristov, Andreja ; Brozović, Anamaria (ur.).
Zagreb : Farmaceutsko-biokemijski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2003. 14-14 (pozvano predavanje,domaća recenzija,sažetak,znanstveni).
|
24. Weygand-Đurašević, Ivana.
Fidelity of decoding by aminoacyl-tRNA synthetases // 1st Central European Conference "Chemistry towards Biology" / Kaučič, Venčeslav ; Mali, Gregor (ur.).
Ljubljana : Slovenian Chemical Society, 2002. 37 (pozvano predavanje,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
|
|
|
|
|
|
Neobjavljena sudjelovanja na skupovima
|
|
|
|
|
Disertacije
|
|
1. Bilokapić, Silvija.
Uloga cinkovog iona u aktivnom mjestu atipične arhealne seril-tRNA-sintetaze: strukturna i biokemijska analiza / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 10.11. 2006.,
106 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
2. Bilokapić, Silvija.
The role of zinc ion in the active site of atypical archael seryl-tRNA synthetase: Structure and biochemical analysis / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 10.11. 2006,
106 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
3. Korenčić, Dragana.
Dvije seril-tRNA-sintetaze u metanogenoj arheji Methanosarcina barkeri / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 15.05. 2004.,
102 str. Voditelj: Soll, Dieter ; Weygand-Đurašević, Ivana.
|
4. Rokov Plavec, Jasmina.
Organelna seril-tRNA-sintetaza iz kukuruza: karakterizacija in vitro i in vivo / doktorska disertacija.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 09.12. 2004.,
120 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
|
|
|
|
|
Diplomski radovi
|
|
1. Dulić, Morana.
Stanična lokalizacija organelne seril-tRNA-sintetaze iz kukuruza / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 31.01. 2006.,
81 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
2. Miljević, Branka.
Konstrukcija mutanata kukuruzne citosolne seril-tRNA-sintetaze s izmijenjenom C-terminalnom regijom / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 03.07. 2006.,
64 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
3. Nestić, Anita.
Dobivanje rekombinantnih proteina suvremenim ekspresijskim sustavima: primjer kvaščeve seril-tRNA-sintetaze / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 02.06. 2005.,
59 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
4. Boko, Draško.
Supresija amber mutacije u bakteriji Escherichia coli arhealnim ortolognim parom seril-tRNA-sintetaze i supresorske tRNA / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 07.07. 2004,
79 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
5. Brgles, Marija.
Interakcija tRNASeriz arheje Methanopyrus kandleri s homolognim i heterolognim seril-tRNA-sintetazama / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 06.04. 2004,
60 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
6. Slade, Dea.
INHIBICIJA PROKARIOTSKIH I EUKARIOTSKIH AMINOACIL-tRNA-SINTETAZA ANALOZIMA SERINA / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 05.07. 2004,
88 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
7. Glavan, Filip.
Strukturna i funkcionalna svojstva seril-tRNA-sintetaze iz hipertermofilne arheje / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 23.09. 2003,
68 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
8. Godinić, Vlatka.
Kvaščev protein Pex21p kao kofaktor seril-tRNA-sintetaze / diplomski rad.
Zagreb : Prirodoslovno-matematički fakultet, 13.10. 2003,
106 str. Voditelj: Weygand-Đurašević, Ivana.
|
|
|
|
|
|
|